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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003828`

染色体: Chr04 坐标: 54368726-54371768 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003828`
名称	SmilChr04G003828
描述	uncharacterized SmilChr04G003828
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54368726 - 54371768 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020729`
GeneID	`131020729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020729`
原始查询	`LOC131020729`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292]; symbol=AT3G61200; hit=AT3G61200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292]; symbol=AT3G61200; hit=AT3G61200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G61200` (AT3G61200) Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292] identity=40; qcov=0.983; evalue=1.43e-37; confidence=medium
Rice	`Os07g0462700` (OJ1634_H04.108) - identity=35.2; qcov=0.919; evalue=2.48e-25; confidence=medium
GO	GO:0047617 (fatty acyl-CoA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03061 (4HBT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805722.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057805722.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805722.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805722.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805722.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54368901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C16,C32,C33,C68
`Chr4:54369932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:54369962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:54371510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B63,B69,C26
`Chr4:54371557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805722.1

173 aa

173

4HBT

PF03061 4HBT 80-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805722.1`	Pfam	`PF03061`	4HBT	Domain	80	154	1.3e-08	35.8	Thioesterase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949739.1
AAAAAGAAAAATCTAAATTGTTTTTTCAACGAGGAACCTCCAGATAGGATGCGATGCAACAATTGATTTTTTTTGGCGCCACTTGAGAAAGGGAAAAAATTACTAACAATTTCAAAGTCGCGTGAAAATGCCGCGCATTAACAATAATAGAAAGTTCCAGACGAGTAGAATTGCTGAAAAAGAAGAGAGAGAAAGCGAGAAAAACAATGGCGGCCACCACCAGCAAGGAAATTCCGGCGGCGGAGGCTGAGATCTCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020729
ATGGCGGCCACCACCAGCAAGGAAATTCCGGCGGCGGAGGCTGAGATCTCCCCCAACGACTACCGAATCGTTGTTGAATTTCTGGAAGATTGGGGGCTTGCTTCCTCAATCAAACCAGAATACAACGTTAATGACGCCTTCTCCAAAGTCGTAGGCGGAGTTCTCAAACTCATCTCCGCCCACAGGGGCAAAATCTCCTGCATTCTCAGCGCTAAACCGCCGGTTCTGAATGGAATCGGTAGACTGCATGGGGGTGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805722.1
MAATTSKEIPAAEAEISPNDYRIVVEFLEDWGLASSIKPEYNVNDAFSKVVGGVLKLISAHRGKISCILSAKPPVLNGIGRLHGGAVASVAERVAIACAKTVVHKDEDLFLGDLSISYLSSAPRNAEIVVDAFVISSEKKQAIIGLNFRIEETGRLLYLSRATFESMPLSSRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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