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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003892`

染色体: Chr04 坐标: 54716237-54718448 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003892`
名称	SmilChr04G003892
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54716237 - 54718448 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020731`
GeneID	`131020731`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020731`
原始查询	`LOC131020731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 39
Arabidopsis	`AT1G01490` (AT1G01490) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839440] identity=42.2; qcov=1.14; evalue=9.44e-29; confidence=medium
Rice	`Os03g0126700` - identity=56.4; qcov=0.494; evalue=2.73e-25; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020731

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805725.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805725.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057805725.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805725.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54716990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr4:54717828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr4:54717976`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr4:54717976`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C76
`Chr4:54718003`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	119	A10,A11,A13,A14,A19,A2,A21,A22,A3,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B103,B108,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B12,B122,B124,B125,B126,B128,B13,B130,B133,B137,B138,B139,B14,B15,B17,B2,B20,B21,B25,B35,B36,B38,B39,B40,B46,B49,B50,B52,B53,B54,B58,B60,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B75,B77,B80,B83,B84,B85,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B94,B95,C10,C14,C2,C20,C23,C25,C27,C3,C31,C35,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C50,C54,C57,C6,C64,C66,C77,C79,C80,C82,C83,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D5,D6,D9
`Chr4:54718068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:54718134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:54718147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949742.1
ACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCCCATTTCCTTTGGAGAAACGCGCACTGATTCCCATTTCTCTTCTCCACTTTTCTCATCTAGTGAGAGAAACAGAGAGGCTCTCACAAATTTATTTCTCCTTTTTCAGCACCTCAACGAAACATGAAGAAGTTTGTTCTGAAACTGGATCTGGAAGAGGACAGAGACAAAAGAAGGGCTCTCAAAACAGTGGCGACGCTTTCAGGAATCGACGAGATCACCGTCGACATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020731
ATGAAGAAGTTTGTTCTGAAACTGGATCTGGAAGAGGACAGAGACAAAAGAAGGGCTCTCAAAACAGTGGCGACGCTTTCAGGAATCGACGAGATCACCGTCGACATGAAGGGGAAGACGCTAATGGTGGTTGGGACAGTCGATCCGGTGAGGGTGGTGAGCAAGCTGCGCAAGAAGAACTGGCGAGTGGACATCATCTCGGTCGGCCCATCCAAGGATCCGGAGAAGAAGGAGGATGGGAAGAAAGACGAGGCGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805725.1
MKKFVLKLDLEEDRDKRRALKTVATLSGIDEITVDMKGKTLMVVGTVDPVRVVSKLRKKNWRVDIISVGPSKDPEKKEDGKKDEAKKDEEKKDEGKKEEPQKEGKKKEGEAKKDDEKKAETDPVVGTVMPFRQYYPPMNTYYYVHHSMEENPNACVIS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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