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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003823`

染色体: Chr04 坐标: 54349921-54352677 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003823`
名称	SmilChr04G003823
描述	uncharacterized SmilChr04G003823
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54349921 - 54352677 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020733`
GeneID	`131020733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020733`
原始查询	`LOC131020733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292]; symbol=AT3G61200; hit=AT3G61200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292]; symbol=AT3G61200; hit=AT3G61200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G61200` (AT3G61200) Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292] identity=35.7; qcov=0.987; evalue=3.75e-30; confidence=medium
Rice	`Os07g0462700` (OJ1634_H04.108) - identity=34.5; qcov=0.949; evalue=5.44e-24; confidence=low
GO	GO:0047617 (fatty acyl-CoA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03061 (4HBT); PF13622 (4HBT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057805727.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805727.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805727.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805727.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54349978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:54350044`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B111,B129,B139,B36,B8,B85,B93,C5,C6,C7
`Chr4:54350070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C37
`Chr4:54350080`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	34	A14,A21,A7,B103,B106,B113,B12,B132,B137,B16,B18,B19,B35,B37,B40,B48,B51,B54,B72,B76,B77,B83,B84,B98,C19,C20,C25,C36,C37,C43,C53,C61,C62,D4
`Chr4:54350083`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B111,B129,B139,B36,B8,B85,B93,C5,C6,C7
`Chr4:54351086`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A8,B10,B138,B45,B85,C11,C19,C38,C69,C9,D2
`Chr4:54351164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,C42
`Chr4:54351172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr4:54351175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:54351186`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C46,C79
`Chr4:54352591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,B124,B97,C40
`Chr4:54352633`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	B133,B49,B52,B79,B88,C20,C22,C25,C41,C48,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805727.1

156 aa

156

4HBT_3

4HBT

PF13622 4HBT_3 64-133 aa PF03061 4HBT 64-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805727.1`	Pfam	`PF13622`	4HBT_3	Domain	64	133	6.5e-07	30.2	Acyl-CoA thioesterase N-terminal domain
`XP_057805727.1`	Pfam	`PF03061`	4HBT	Domain	64	138	8.2e-11	42.8	Thioesterase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949744.1
ACACATAGATCTAGAGAGAGAGAGAGAGACAGAGAGATGGAGAGTCCAAACTACGAAGCAGCAATAGGATTTATGGAGAGAGCAGGGATGGGTGGGATTGTGGGAGCAGAATACAACGTTAATGACTCCTTCTCCACAGTGGTGGGAGGAGCTCTTAAGCTTGTCTCAACGGAAAGGGCCAAAATCTGTTGCATTCTCCACGTCAAACCTCCTATTCTGAATGCTAACGGCATACTGTTTGGAGGCGCGGTGGCGGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020733
ATGGAGAGTCCAAACTACGAAGCAGCAATAGGATTTATGGAGAGAGCAGGGATGGGTGGGATTGTGGGAGCAGAATACAACGTTAATGACTCCTTCTCCACAGTGGTGGGAGGAGCTCTTAAGCTTGTCTCAACGGAAAGGGCCAAAATCTGTTGCATTCTCCACGTCAAACCTCCTATTCTGAATGCTAACGGCATACTGTTTGGAGGCGCGGTGGCGGCCGTGGCTGAGAGGGTGGCGATAGGTTGTGCTGCAACTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805727.1
MESPNYEAAIGFMERAGMGGIVGAEYNVNDSFSTVVGGALKLVSTERAKICCILHVKPPILNANGILFGGAVAAVAERVAIGCAATILGHSQLCVGEFTISYLAPAPPNAEIIVNASVINGGRNVAVVALDFRLKESQRLAYVSRVTLYKIPLSNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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