当前解析结果
SmilChr04G003857| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003857 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003857 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003857 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 54516779 - 54517998 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020737 |
|---|---|
| GeneID | 131020737 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020737 |
| 原始查询 | LOC131020737 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020737 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805731.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057805731.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057805731.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805731.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805731.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:54516968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C47 |
Chr4:54516969 |
A |
ACT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 53 | A1,A14,A18,A22,A23,B10,B101,B106,B109,B122,B124,B127,B136,B138,B24,B26,B32,B36,B37,B38,B39,B42,B43,B44,B46,B54,B57,B64,B69,B7,B80,B82,B86,B89,B91,C13,C14,C19,C26,C32,C34,C43,C44,C48,C62,C64,C65,C66,C68,C76,C8,C86,D8 |
Chr4:54517085 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B133,B97,C40 |
Chr4:54517437 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
Chr4:54517468 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,C15 |
Chr4:54517531 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B55,C15,C4 |
Chr4:54517538 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A25,B121,B34,C12,C63,C72 |
Chr4:54517559 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A18,B117,B78,C36,C85 |
Chr4:54517559 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B117,B78,C36,C85 |
Chr4:54517583 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B55 |
Chr4:54517583 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B55 |
Chr4:54517603 |
GAA |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 17 | A7,B108,B118,B18,B40,B48,B6,B61,B98,C15,C34,C52,C61,C63,C78,D4,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。