当前解析结果
SmilChr01G001761| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001761 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001761 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001761 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 32341945 - 32346332 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020744 |
|---|---|
| GeneID | 131020744 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020744 |
| 原始查询 | LOC131020744 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020744 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057805743.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057805743.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805743.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805743.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805743.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:32342434 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B76,C47 |
Chr1:32342434 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B76,C47 |
Chr1:32342436 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | B139,B21,B96,C3,C45,C62,D5 |
Chr1:32342438 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B133,B76,C47 |
Chr1:32342448 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 24 | A14,A23,B110,B112,B132,B138,B39,B42,B68,B93,C12,C26,C35,C36,C43,C44,C53,C63,C70,C78,C80,C84,C85,D5 |
Chr1:32342460 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A11,B79,B86,C47 |
Chr1:32342468 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | B14,B32,B5,B54,B57,B80,C23,C30,C44 |
Chr1:32342476 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A11,B100,B67,B79,D8 |
Chr1:32342490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B97,C56,C7,C74,D6 |
Chr1:32342491 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 55 | A16,A19,A20,A4,A5,A7,B102,B103,B104,B119,B12,B15,B16,B21,B24,B3,B30,B34,B37,B40,B41,B47,B49,B51,B53,B54,B60,B61,B65,B69,B75,B77,B78,B86,B89,B99,C10,C16,C17,C19,C25,C27,C30,C33,C38,C41,C43,C47,C48,C53,C59,C71,C76,C81,D11 |
Chr1:32342493 |
AC |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | B10,B120,C66 |
Chr1:32342494 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B97,C43,C62,C74 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。