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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001759`

染色体: Chr01 坐标: 32297319-32298592 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001759`
名称	SmilChr01G001759
描述	uncharacterized SmilChr01G001759
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32297319 - 32298592 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020751`
GeneID	`131020751`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020751`
原始查询	`LOC131020751`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome-c oxidase/ electron carrier [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827858]; symbol=AT4G21105; hit=AT4G21105; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	cytochrome-c oxidase/ electron carrier [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827858]; symbol=AT4G21105; hit=AT4G21105; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G21105` (AT4G21105) cytochrome-c oxidase/ electron carrier [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827858] identity=83.1; qcov=0.942; evalue=3.5e-36; confidence=medium
Rice	`Os02g0162000` - identity=70.8; qcov=0.942; evalue=2.52e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02238 (COX7a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020751

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805750.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057805750.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057805750.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805750.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32298021`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B75,D10
`Chr1:32298021`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr1:32298022`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B75,D10
`Chr1:32298022`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B75,D10
`Chr1:32298207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:32298241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805750.1

69 aa

COX7a

PF02238 COX7a 12-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805750.1`	Pfam	`PF02238`	COX7a	Family	12	64	1.3e-15	58.2	Cytochrome c oxidase subunit VII

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949767.1
AGGCAAGTAGTTTTTTTCTGTTGCTATCAACTTCTGAGTTCTGAGATTTTTTCTGCTTGAATGTATAAGATGTTTTCATGTGTGTACGCTTTCGCAATTTATCTTGTATTGGATGAAGATCTCTAAAATGAAAAATGTTTTTTTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGATGAAGCATATCTGGAATAGAGAATACTACGATAATGTTTTCAAGTCGATGTGGCATCGATAAACTGTTTGGTGCAAAAAAATATTTTCGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020751
ATGTGTACGATTGAGCCGCCCTTCAGGCCAAGAGAGAAGCTCATCGAAAAGCAGAAGCATTTCCAAAGCATACACAAACACACTTATTTAAAAGGACCATTTGACAAAATCACCTCAGTTGCCATTCCTCTTGCTTTGGCTGCCTCTTCTCTCTATCTCATTGGGAGAGGGATCTACAATATGTCTCATGGGATTGGGAAGAAGGAATAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805750.1
MCTIEPPFRPREKLIEKQKHFQSIHKHTYLKGPFDKITSVAIPLALAASSLYLIGRGIYNMSHGIGKKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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