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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003894`

染色体: Chr04 坐标: 54748594-54749679 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003894`
名称	SmilChr04G003894
描述	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54748594 - 54749679 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020760`
GeneID	`131020760`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020760`
原始查询	`LOC131020760`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
产物	late embryogenesis abundant protein At1g64065-like
Arabidopsis	`AT2G46150` (AT2G46150) Late embryosis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819222] identity=49.1; qcov=0.996; evalue=9.41e-72; confidence=high
Rice	`Os01g0736500` - identity=37.8; qcov=1.01; evalue=9.77e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03168 (LEA_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020760

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805751.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805751.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805751.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805751.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54748692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C14
`Chr4:54748699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr4:54748712`	`G`	`GCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A13,A3,B12,B128,B9,C57,D2
`Chr4:54748721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B61,C53
`Chr4:54748737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:54748801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:54748872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B7,C55,C84
`Chr4:54748891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B7,B88,C55,C84
`Chr4:54748904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr4:54748962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B58,C4
`Chr4:54749053`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr4:54749053`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805751.1

223 aa

112

223

LEA_2

PF03168 LEA_2 104-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805751.1`	Pfam	`PF03168`	LEA_2	Domain	104	202	1.3e-11	45.5	Late embryogenesis abundant protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949768.1
AGAAAAATATTCCTCCAAAAAAAAAAAATCCAATTCTCTACAAATGGTGGAAACGTCCGAGCAAATCCGGCCGCTCGCCCCTGCCTCGGAGCGCCCCACCAGCAGCGACGACGAGGCCGGCGCCACCGCCGTCGGCGGCGGCCGCCGCAGGCGGCAGCAACTGCTCCGCTGCTGCGGCTGCTGCGGCGCGGTCGTCCTCCTCCAGGCCGTCGTGATCGTGATCCTGATCTTCACCGTGTTCAAGGTGAAGGATCCGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020760
ATGGTGGAAACGTCCGAGCAAATCCGGCCGCTCGCCCCTGCCTCGGAGCGCCCCACCAGCAGCGACGACGAGGCCGGCGCCACCGCCGTCGGCGGCGGCCGCCGCAGGCGGCAGCAACTGCTCCGCTGCTGCGGCTGCTGCGGCGCGGTCGTCCTCCTCCAGGCCGTCGTGATCGTGATCCTGATCTTCACCGTGTTCAAGGTGAAGGATCCGGTGATCCGGCTGAACGGCGTGACGGTGGACCGGCTGGATCTGATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805751.1
MVETSEQIRPLAPASERPTSSDDEAGATAVGGGRRRRQQLLRCCGCCGAVVLLQAVVIVILIFTVFKVKDPVIRLNGVTVDRLDLINGTATPRPGSNMSLTADVSVKNPNFASFRYPETTSALFYRGAAIGEARGPAGRARARRTARMNVTVEVIADRVLAQPDLGSDINSGLLTLGSYTEVGGKVKILMVKKHVRVTMNCSLTVNVTSQAIQGQKCKRKVKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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