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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003912`

染色体: Chr04 坐标: 54848704-54850082 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003912`
名称	SmilChr04G003912
描述	uncharacterized SmilChr04G003912
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54848704 - 54850082 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020773`
GeneID	`131020773`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020773`
原始查询	`LOC131020773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0118600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0118600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G01140` (AT4G01140) transmembrane protein, putative (DUF1191) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828157] identity=31.4; qcov=0.926; evalue=4.56e-37; confidence=low
Rice	`Os11g0118600` - identity=35.6; qcov=1.07; evalue=4.57e-49; confidence=medium
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF06697 (DUF1191)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020773

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805767.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805767.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805767.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805767.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54849103`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D4
`Chr4:54849103`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D4
`Chr4:54849185`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	132	A13,A14,A16,A2,A24,A5,A6,A7,A8,A9,B100,B101,B102,B103,B104,B11,B112,B115,B117,B118,B119,B12,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B132,B134,B135,B136,B139,B140,B16,B19,B20,B21,B23,B25,B31,B32,B34,B36,B37,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B53,B54,B58,B6,B61,B63,B65,B66,B67,B7,B71,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B84,B86,B89,B9,B93,B94,B96,B98,C11,C14,C16,C17,C21,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C38,C40,C41,C42,C43,C44,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C58,C6,C60,C61,C62,C67,C69,C7,C70,C77,C78,C80,C81,C82,C85,C86,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D8
`Chr4:54849267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C48
`Chr4:54849283`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C53
`Chr4:54849357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D6
`Chr4:54849545`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr4:54849545`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr4:54849554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B21,C74
`Chr4:54849583`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr4:54849583`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805767.1

285 aa

142

285

DUF1191

PF06697 DUF1191 32-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805767.1`	Pfam	`PF06697`	DUF1191	Family	32	205	1.1e-50	172.6	Protein of unknown function (DUF1191)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949784.1
AAAATCATGAAGAAGCCTACAATTAAAAGAAGCTTAAAATAGACAGCACACGAATGTGGACACTTAGTATATCACAATCCACATTTCCCACACAAAGCCTTTCTTTCCCGATCCTTTTCGTTTAATTTCCTTTTGCTTTCTCAACTTTTATCTCGAGATTTATCGATTAATCTTTCCATAGCTGCAATTAATCCTTTCTTGATACACATTAATTCCCATTTGATCATCAAAACCCCCCAAAAAAGAGTGTCGAAAACTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020773
ATGGGGCACAATTGCAGAAGGGATTGTGTCATCGCTCTCATCGTGTTGAATGCATGGCTATGGCAGCTCGTTGAGGGATCATCAATATCATCATCGGAGAGGGATTCATTTCTCTACGATTACGCGTTCAAGAAGATCAAGAAGCTCCGGTCGGGGGAGGTGTACGACGTCGCCCCTCCGGCCAACTTCTCCGGCGTGGAGGTGGCCGTGGCCCGGGTGCGGCGGCGCAGCCTGTGGAGGAAAGGGCTCACCATCGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805767.1
MGHNCRRDCVIALIVLNAWLWQLVEGSSISSSERDSFLYDYAFKKIKKLRSGEVYDVAPPANFSGVEVAVARVRRRSLWRKGLTIGAVAIPARTLPRPFTRRVDLVYQNLGNWSSHYYDVPNHTFVAPVLGFLAYDSNGSGAIELRGGGDDDPLLLNFSGVAYGGVGGATRCVRFDRDGRLELEGTTRGSSCVVRAQGHFSLVVPRKAKRGYKWWVVGVGGGALGLVGVVLVVVGWKRLNRKKIKKMEQEAERCVGLETM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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