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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003915`

染色体: Chr04 坐标: 54865196-54868355 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003915`
名称	SmilChr04G003915
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54865196 - 54868355 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020778`
GeneID	`131020778`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020778`
原始查询	`LOC131020778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 28-like
Arabidopsis	`AT1G64230` (UBC28) ubiquitin-conjugating enzyme 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842728] identity=96.6; qcov=1; evalue=1.79e-107; confidence=high
Rice	`Os04g0667800` (Dhr6) - identity=96.6; qcov=1; evalue=2.16e-107; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil03083 (Polycomb repressive complex - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020778

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805777.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057805777.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805777.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805777.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805777.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54865573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:54866311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B55,B72,C38
`Chr4:54866341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:54866347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr4:54866368`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805777.1

148 aa

148

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-141 aa

XP_057805778.1

148 aa

148

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-141 aa

XP_057805779.1

148 aa

148

UQ_con

PF00179 UQ_con 5-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805777.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	141	2.9e-55	186.4	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057805778.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	141	2.9e-55	186.4	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057805779.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	5	141	2.9e-55	186.4	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949794.1
TATTGGAGGGGGAATAAGACAAGCCGATATCACATGAAAACAGAAAACAGTCCAATCATTTGAAGGAAAAAAGCAGTAGTAAAATCTTGCACTTATATTTTAATTTTATATTAATAATTAATTAATATTGAGTGCTATATTCTTCAAAATCAGTTTCATCGCGTCAAGATCAAGAAGCGGCAGCTGAACAAGAAGCAAAAAGGCGAATCAACTGAGCAAGTCTTCGCCTCTCTCTCTTCTCTCTGGGCAATCAAAAGATC...

XM_057949795.1
AATCATTTGAAGGAAAAAAGCAGTAGTAAAATCTTGCACTTATATTTTAATTTTATATTAATAATTAATTAATATTGAGTGCTATATTCTTCAAAATCAGTTTCATCGCGTCAAGATCAAGAAGCGGCAGCTGAACAAGAAGCAAAAAGGCGAATCAACTGAGCAAGTCTTCGCCTCTCTCTCTTCTCTCTGGTCAAAAGATCGGATTTTTCTTCGATGGCTTCCAAACGGATCTTGAAGGAGCTCAAGGATTTGCAGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020778
ATGGCTTCCAAACGGATCTTGAAGGAGCTCAAGGATTTGCAGAAGGATCCCCCGACTTCTTGCAGCGCAGGACCTGTTGGTGAAGACATGTTTCACTGGCAGGCAACGATAATGGGTCCACAGGATAGTCCGTATGCGGGAGGAGTGTTTTTAGTCACTATTCATTTCCCCCCCGATTATCCTTTCAAGCCTCCGAAGGTTGCATTCAGGACAAAGGTTTTTCACCCAAACATTAACAGCAATGGTAGCATATGCCTCGA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057805777.1
MASKRILKELKDLQKDPPTSCSAGPVGEDMFHWQATIMGPQDSPYAGGVFLVTIHFPPDYPFKPPKVAFRTKVFHPNINSNGSICLDILKEQWSPALTISKVLLSICSLLTDPNPDDPLVPEIAHMYKTDRAKYEQTARSWTQKYAMG

XP_057805778.1
MASKRILKELKDLQKDPPTSCSAGPVGEDMFHWQATIMGPQDSPYAGGVFLVTIHFPPDYPFKPPKVAFRTKVFHPNINSNGSICLDILKEQWSPALTISKVLLSICSLLTDPNPDDPLVPEIAHMYKTDRAKYEQTARSWTQKYAMG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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