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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003921`

染色体: Chr04 坐标: 54889238-54894088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003921`
名称	SmilChr04G003921
描述	mitochondrial adenine nucleotide transporter ADNT1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54889238 - 54894088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020781`
GeneID	`131020781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020781`
原始查询	`LOC131020781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial adenine nucleotide transporter ADNT1-like
产物	mitochondrial adenine nucleotide transporter ADNT1-like
Arabidopsis	`AT4G01100` (ADNT1) adenine nucleotide transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827899] identity=82.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0585900` - identity=81.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805783.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057805783.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057805783.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805783.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805783.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54889644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B119,C3,C49,C86
`Chr4:54889886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C29,C64,C66
`Chr4:54889965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B91
`Chr4:54889984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:54890002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:54892571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:54892951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C45,C67,D5
`Chr4:54892978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B104,B78,B9
`Chr4:54892996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B7,C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805783.1

354 aa

177

354

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 38-125 aa PF00153 Mito_carr 141-233 aa PF00153 Mito_carr 244-346 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805783.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	38	125	1.2e-84	278.9	Mitochondrial carrier protein
`XP_057805783.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	141	233	1.2e-84	278.9	Mitochondrial carrier protein
`XP_057805783.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	244	346	1.2e-84	278.9	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949800.1
ACGTTTTAGGGTACAACCAACAAAGCGAGGGTACAATCGCAGCGAATGAGAGCTCTATAACTGTAATAAATTATCGTTAAAATATCGGGTGAGAAAGTCAAGCAAAAGAAGCTCACTCTTATATTTTCATTTCACACAAACGCCGTCACTTATAAACAGCAGCCACACACAAAAACACACTCACTGCGTGCCGCATTCGCCTTCGCCCCCCAACCTCCCGTCTCTCCGCCCCCACAGCCCGCCGGCGCCGCGTCAAGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020781
ATGGCGTCGGAGGATGTGAAGACGAGCGAATCGGCGGTGTCGAAGATTGTTAATTTGGCGGAGGAGGCGAAGCTCGCGAAGGAGGAAATCAAGCCTACTAAGTATCAAGTTTATAGTATCTGCAAATCTCTCATCGCTGGTGGCGTCGCTGGAGGAGTGTCGCGAACCGCTGTAGCTCCGTTGGAACGTCTGAAAATTCTGCTTCAGGTTCAAAATTCACAGAATATAAAGTACAATGGTACTATTCAAGGGTTGAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805783.1
MASEDVKTSESAVSKIVNLAEEAKLAKEEIKPTKYQVYSICKSLIAGGVAGGVSRTAVAPLERLKILLQVQNSQNIKYNGTIQGLKYIWRTEGFRGLFKGNGTNCARIVPNSAVKFFSYEQASKGILYLYQQQTGNEDAQLTPVLRLGAGACAGIIAMSATYPMDMVRGRITVQTETSAYQYRGMFHALSTVLREEGFRALYKGWLPSVIGVVPYVGLNFAVYESLKDWLIKSKAFGLVEDNELGVATRLACGAAAGTVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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