当前解析结果
SmilChr04G003922| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003922 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003922 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003922 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 54898614 - 54900057 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020785 |
|---|---|
| GeneID | 131020785 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020785 |
| 原始查询 | LOC131020785 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020785 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805789.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805789.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805789.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805789.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057805789.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:54898808 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B44,D6 |
Chr4:54898833 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B42 |
Chr4:54898866 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B33 |
Chr4:54898866 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B33 |
Chr4:54898896 |
GT |
G |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A11,A14,B107,B112,B12,B140,B49,B58,B60,B66,B95,C20,C61,C63 |
Chr4:54898960 |
AG |
* |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | A18,B140,B81,C12,C24 |
Chr4:54898986 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B98,C72,D9 |
Chr4:54899015 |
G |
GAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 6 | B122,B129,B94,C22,C3,C55 |
Chr4:54899023 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B118,B12,C86 |
Chr4:54899024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B135 |
Chr4:54899032 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A15,B108,B110,B56 |
Chr4:54899040 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B28,C17 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。