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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003936`

染色体: Chr04 坐标: 54989547-54994002 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003936`
名称	SmilChr04G003936
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54989547 - 54994002 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020799`
GeneID	`131020799`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020799`
原始查询	`LOC131020799`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic nucleotide-gated ion channel 1-like
产物	cyclic nucleotide-gated ion channel 1-like
Arabidopsis	`AT5G53130` (CNGC1) cyclic nucleotide gated channel 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835393] identity=67.5; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0527100` (OsCNGC12) - identity=57.8; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005216 (monoatomic ion channel activity); GO:0006811 (monoatomic ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020799

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805805.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805805.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805805.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805805.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54990470`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr4:54990470`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr4:54990541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr4:54990589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C42
`Chr4:54990622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C47
`Chr4:54990642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:54990653`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B22
`Chr4:54990653`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B22
`Chr4:54990659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B4,C29,D11
`Chr4:54990774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54990777`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr4:54990777`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805805.1

649 aa

324

649

Ion_trans

PF00520 Ion_trans 37-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805805.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	37	353	1.4e-19	71.0	Ion transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949822.1
TCATCGTTTCAGATTCAACGATCGAAGCTCCGAAAACTTGTTCACCCCGAACCGGAATGGCAACCTGTTCGGATTAAGGAAACCGAGCCTGAGCTCGATTAAGGGCAAAAATCCGATCCAAAATCCGAATACTCACCCCCCTAAGTTGAATCGCAGACGGAATCCTACAAGGATTCGACCGAGTCCACGGGAGCCTGAGCTCGATCGCAGCCGGAATAAGGCGAGGATTCGACAGAGGCTCCCAAAGGATGAAAAGTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020799
ATGAAAAGTTTAAGAAGATGGCAGGAGCCTCCTCCACAAAAGATCAGGGAGCCAAAGAAGAGACGCATCCTCGATCCTCAGGGGAATTTCCTGCAGCAATGGAACAAGATCTTCGCGGTGTCGTGCATCATCGCCGTCTCCCTCGACCCCCTCTTCTTCTACATTCCGGTGATCGTGCGCGACCAGTTCTGCCTGACGCTCGACAAAAAGGTCGAGATCGCCGCCTGCGCGCTCCGATCCTTGGTGGACATGTTCTACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805805.1
MKSLRRWQEPPPQKIREPKKRRILDPQGNFLQQWNKIFAVSCIIAVSLDPLFFYIPVIVRDQFCLTLDKKVEIAACALRSLVDMFYVFHIVLQFRTGFIAPPSRVFGRGELVEDSGEIAKRYLKSYFVVDVLSILPLPQAVVLMVRQVTKGPISHATKELLKAVIYIQYIPRIWRIFPLYREVTRTSGIFTETAWAGAAFNLFLYMLASHVLGAFWYLFAIERKETCWREACGYNSSCNVDNLYCNGVGSNALFLNSSCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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