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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003946`

染色体: Chr04 坐标: 55056758-55059638 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003946`
名称	SmilChr04G003946
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g61750
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55056758 - 55059638 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020808`
GeneID	`131020808`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020808`
原始查询	`LOC131020808`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g61750
产物	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g61750
Arabidopsis	`AT3G61750` (AT3G61750) Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane with DOMON related domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825348] identity=49.7; qcov=0.946; evalue=1.38e-131; confidence=high
Rice	`Os05g0556400` - identity=50.7; qcov=0.902; evalue=1.06e-124; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561); PF03351 (DOMON)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020808

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805821.1`
2	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057805821.1`
3	Endosome	内体	0.20000	`XP_057805821.1`
4	Endosome membrane	内体膜	0.20000	`XP_057805821.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805821.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55058154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:55058161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B53,C5
`Chr4:55058361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:55058490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C25
`Chr4:55058549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B98,C79
`Chr4:55058622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B73,C24,C41
`Chr4:55058663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:55058666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr4:55058678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:55058720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C33
`Chr4:55058747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:55058753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805821.1

389 aa

194

389

DOMON

Cytochrom_B561

PF03351 DOMON 57-156 aa PF03188 Cytochrom_B561 213-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805821.1`	Pfam	`PF03351`	DOMON	Domain	57	156	3.4e-12	47.4	DOMON domain
`XP_057805821.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	213	333	4.1e-07	31.0	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949838.1
AAGCCTCTACAAAATTGGTATCATTCTCGGCAGCTTCATTTCAGCACAGCACAGAGCTCTCTACCTATGGAGCAATGCTTTGCTTTGGCAATGTTATTGAGTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGCGACGGCGGCGGGAGGAATGGGCTGTGCAACACAGATCTCACCACATTTCTTCCTTTTCCATACAGCAACCTACCTAACATGGTCTGTCAACCACTGTGGAACTCATATTTGTTAAGGTATTCCCGGTCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020808
ATGGAGCAATGCTTTGCTTTGGCAATGTTATTGAGTTTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGGCGACGGCGGCGGGAGGAATGGGCTGTGCAACACAGATCTCACCACATTTCTTCCTTTTCCATACAGCAACCTACCTAACATGGTCTGTCAACCACTGTGGAACTCATATTTGTTAAGGTATTCCCGGTCGAAGGATAACGAGATCACGATCGTGTTGTCGACCATATACACGAGCGGGTGGGTGGGGATGGGATTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805821.1
MEQCFALAMLLSLAAAAAAEGDGGGRNGLCNTDLTTFLPFPYSNLPNMVCQPLWNSYLLRYSRSKDNEITIVLSTIYTSGWVGMGFSRDGKMLNSSCIVGWVNPEGQGRIKQYHIKGFTPSEIKPDRGELPLTNVPPYVAVQGATIYLSFQLKFNTTLKTQPILLAFSTKTPHHHRLTLHDDKTTIYFDFSEGKTDSSVESSSPSIFKDRRTHGTLGVLGWGFFLPTGAILARYLSRRDRVWYYFHVPLQFIGFLLGVAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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