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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003949`

染色体: Chr04 坐标: 55065723-55070890 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003949`
名称	SmilChr04G003949
描述	dynamin-related protein 5A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55065723 - 55070890 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020810`
GeneID	`131020810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020810`
原始查询	`LOC131020810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynamin-related protein 5A-like
产物	dynamin-related protein 5A-like
Arabidopsis	`AT5G42080` (DL1) dynamin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834213] identity=84.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0556100` (OsDRP1A) - identity=87; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N); PF01031 (Dynamin_M); PF02212 (GED)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805823.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805823.1`
3	Phragmoplast	Phragmoplast	0.60000	`XP_057805823.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057805823.1`
5	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057805823.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55066141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A18,B104,C73,C82
`Chr4:55066288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:55066490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C82
`Chr4:55066547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C85,D5
`Chr4:55066589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B91
`Chr4:55066796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55066928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B17,C7
`Chr4:55068013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr4:55068070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C48,D10
`Chr4:55068817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr4:55069507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B64,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805823.1

609 aa

304

609

Dynamin_N

Dynamin_M

GED

PF00350 Dynamin_N 37-212 aa PF01031 Dynamin_M 220-488 aa PF02212 GED 513-605 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805823.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	37	212	2.1e-55	188.0	Dynamin family
`XP_057805823.1`	Pfam	`PF01031`	Dynamin_M	Family	220	488	1.2e-63	215.7	Dynamin central region
`XP_057805823.1`	Pfam	`PF02212`	GED	Family	513	605	3.9e-22	79.0	Dynamin GTPase effector domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949840.1
GGCTTTTTAGCCCATACTAAGCTTGAAAGTGGCTAATCGCTGTTTCCTATTTCCATGCAGCGTTTGAAATTTCAAAAAGGCGACGAAGAATGAGTCTGCATTTCTCTCTCCGTTGCCACCATGCACACCACACCATCATCGCCTAAGCGCTTTTCTCCTTTCATTTCCACCAATTCTCTTCATCTAATTAACACCGTCGGATTTTGTTTTCCGAAATTTTCCGCAACGGATTGAGATTTTTTATATTTTTTTCCAAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020810
ATGGAGAATCTGATAAATTTAGTTAACAGACTGCAGAGAGCTTGCACGGCGCTAGGCGATCACGGCGAAGAGAGCGCGTTGCCCACTCTTTGGGATGCCCTGCCGTCAATTGCCGTCGTCGGTGGTCAGAGTTCTGGAAAGTCCTCTGTGCTGGAGAGCATTGTTGGGAAAGACTTTTTGCCTCGCGGATCTGGTATTGTTACTCGACGTCCACTTGTGTTGCAACTTCATCGGATTGATGAAGGGAGAGAATATGCAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805823.1
MENLINLVNRLQRACTALGDHGEESALPTLWDALPSIAVVGGQSSGKSSVLESIVGKDFLPRGSGIVTRRPLVLQLHRIDEGREYAEFGHLPRKRFTDFAAVRKEIADETDRETGRSKQISAVPIYLSIYSPNVVNLTLIDLPGLTKVAVEGQSETIVTDIENMVRSYIEKPNCIILAVSPANQDLATSDAIKISREVDPKGERTFGVLTKIDLMDKGTDAVDILEGRAYKLQFPWIGVVNRSQADINKNVDMIAARRRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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