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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003963`

染色体: Chr04 坐标: 55130110-55131123 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003963`
名称	SmilChr04G003963
描述	protein yippee-like At4g27745
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55130110 - 55131123 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020826`
GeneID	`131020826`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020826`
原始查询	`LOC131020826`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein yippee-like At4g27745
产物	protein yippee-like At4g27745
Arabidopsis	`AT4G27745` (AT4G27745) Yippee family putative zinc-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3770406] identity=62.4; qcov=1.06; evalue=1.26e-42; confidence=medium
Rice	`Os12g0484700` - identity=68.3; qcov=1.06; evalue=8.92e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03226 (Yippee-Mis18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020826

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805849.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805850.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057805850.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057805850.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55130773`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B21,C2,C31
`Chr4:55130773`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B21,C2,C31
`Chr4:55130800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805849.1

108 aa

108

Yippee-Mis18

PF03226 Yippee-Mis18 11-104 aa

XP_057805850.1

95 aa

Yippee-Mis18

PF03226 Yippee-Mis18 11-91 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805849.1`	Pfam	`PF03226`	Yippee-Mis18	Domain	11	104	4.3e-12	46.9	Yippee zinc-binding/DNA-binding /Mis18, centromere assembly
`XP_057805850.1`	Pfam	`PF03226`	Yippee-Mis18	Domain	11	91	2.3e-11	44.5	Yippee zinc-binding/DNA-binding /Mis18, centromere assembly

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949866.1
ATGCTGCAAAGTAGCCTTTTTTTTCCCTACAAAAATCAATGCTTGTGAAGGAATAACAAATAGTTCTTGTATGGTGGGTAGCTTTGGAGTGGAAGTCCAAATGGGACCATTGAGTGTGACCATAAATTATTGATGGCCCATACGCCAAGATTGAATTTAAAATAAAGTTTTGATCAAAACCTCTCCTTTTCAAGGATTAAACATATCATTTCTTGTGTGGAATCCATCACTCAATCTCTTATTTTAATTGCATTGGCTAG...

XM_057949867.1
AAAATAAAGTTTTGATCAAAACCTCTCCTTTTCAAGGATTAAACATATCATTTCTTGTGTGGAATCCATCACTCAATCTCTTATTTTAATTGCATTGGCTAGCATACTTAAATCCTCATTCAACTCATCCTTGTCCTCACTACTAACTCTTTCTCTTAAATCTTTTCTTGCAAAAAAATAACCAAAACCAAGTTTGTTTCAAACATTCATTCATATCCCATCATAATAAAAATGGGTGATTCGATCATCGGTGGTCCAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020826
ATGGGTGATTCGATCATCGGTGGTCCAAGAATTTACAGCTGCTACAAATGCAGAAACCATGTTGCTCTTCATGATGATATTGTCTCAAAGGCCTTTCAGTCGAAAAATGGGAGAGCTTTTCTTTTTTCGCACGCGCAGCACGTGTGTTCGGGTAAGAAGGAGGATCGGCAGATGATGACGGGGCTGCACATGGTGGCGGACGTGCACTGCGCCGACTGCAGGGAAGTTTTGGGGTGGAAGTACGAGAAGGCGTACGAGGA...

LOC131020826
ATGGGTGATTCGATCATCGGTGGTCCAAGAATTTACAGCTGCTACAAATGCAGAAACCATGTTGCTCTTCATGATGATATTGTCTCAAAGGCCTTTCAGCACGTGTGTTCGGGTAAGAAGGAGGATCGGCAGATGATGACGGGGCTGCACATGGTGGCGGACGTGCACTGCGCCGACTGCAGGGAAGTTTTGGGGTGGAAGTACGAGAAGGCGTACGAGGAGTCCCAGAAATACAAGGAAGGCAAGTTCGTGCTCGAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805849.1
MGDSIIGGPRIYSCYKCRNHVALHDDIVSKAFQSKNGRAFLFSHAQHVCSGKKEDRQMMTGLHMVADVHCADCREVLGWKYEKAYEESQKYKEGKFVLEKYKIVKENW

XP_057805850.1
MGDSIIGGPRIYSCYKCRNHVALHDDIVSKAFQHVCSGKKEDRQMMTGLHMVADVHCADCREVLGWKYEKAYEESQKYKEGKFVLEKYKIVKENW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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