当前解析结果
SmilChr04G003970| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003970 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003970 |
| 描述 | protein TILLER ANGLE CONTROL 1 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 55169328 - 55173066 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020831 |
|---|---|
| GeneID | 131020831 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020831 |
| 原始查询 | LOC131020831 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein TILLER ANGLE CONTROL 1 |
| 产物 | protein TILLER ANGLE CONTROL 1 |
| Arabidopsis | AT2G46640 (AT2G46640)NAD-dependent protein deacetylase HST1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819276] identity=27.2; qcov=1; evalue=9.57e-12; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | GO:0001763 (morphogenesis of a branching structure) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020831 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057805854.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057805854.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057805854.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805854.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805854.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:55169711 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C58 |
Chr4:55169779 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr4:55169835 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,A3,B103,B78 |
Chr4:55170089 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A13 |
Chr4:55170108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr4:55170121 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。