当前解析结果
SmilChr01G000577| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000577 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000577 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000577 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 11991947 - 11992411 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020837 |
|---|---|
| GeneID | 131020837 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020837 |
| 原始查询 | LOC131020837 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020837 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805896.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057805896.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805896.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805896.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805896.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:11991949 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B110,C16,D4 |
Chr1:11991950 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A20,A9,C21,C36 |
Chr1:11991957 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B41,C21,C36,D10 |
Chr1:11991964 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C81 |
Chr1:11991975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B14,B47,B63,B65,B67 |
Chr1:11991980 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B110,B75,D4 |
Chr1:11992004 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C41 |
Chr1:11992027 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,B79 |
Chr1:11992029 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 43 | A10,A23,A7,B10,B109,B117,B123,B21,B23,B27,B4,B41,B46,B59,B6,B62,B69,B70,B85,B86,B9,B91,B95,C13,C14,C17,C20,C21,C40,C42,C44,C5,C52,C57,C6,C63,C67,C75,C76,C8,C86,D3,D7 |
Chr1:11992030 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | B106,B47,B93,C60,C61 |
Chr1:11992030 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B106,B47,B93,C60,C61 |
Chr1:11992047 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。