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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003978`

染色体: Chr04 坐标: 55238039-55238940 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003978`
名称	SmilChr04G003978
描述	uncharacterized SmilChr04G003978
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55238039 - 55238940 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020842`
GeneID	`131020842`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020842`
原始查询	`LOC131020842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UvrABC system protein C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825365]; symbol=AT3G61920; hit=AT3G61920; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	UvrABC system protein C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825365]; symbol=AT3G61920; hit=AT3G61920; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G61920` (AT3G61920) UvrABC system protein C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825365] identity=45.5; qcov=1.09; evalue=1.11e-42; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14009 (PADRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020842

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805862.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057805862.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805862.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805862.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805862.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55238239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr4:55238396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr4:55238591`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A16,A19,B102,B104,B105,B11,B115,B119,B124,B130,B133,B134,B20,B36,B38,B49,B5,B64,B71,B84,C1,C25,C29,C39,C47,C57,C67,C73,C75,C84
`Chr4:55238630`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B115,C57,C75
`Chr4:55238630`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B115,C57,C75
`Chr4:55238633`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B115,C57,C75
`Chr4:55238633`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B115,C57,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805862.1

175 aa

175

PADRE

PF14009 PADRE 1-159 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805862.1`	Pfam	`PF14009`	PADRE	Domain	1	159	3e-23	83.9	PADRE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949879.1
ATCCCCTTGTCATTCTTATTTCTCAATCACACCTACAAAGAAAAGAATGCTTGTGTCGGTTGTGGCTGAATCCACACATATTCCATAGTCACGACTCACGAACCCCCCTACCGACATTCGCCCCATCCTCATTTACACATAATTCACTAATCTATAGTCTATACTATAATATTTCATCAATAATATATAAATAGACACCTTCATTTATTTAGCTCCATGACATCCAAAAACACACACATTCAATGGGAAACTGCATATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020842
ATGGGAAACTGCATATTCAAAGCGTTGGGGGTGGCGGTGGAGGACATGGTGAGGGTGGTGACTCCCGACGGCGGCGTGATGGAGCTCTACGCCCCGATCACCGCCGAGTGCGTCACCAACGAGTTCCCCGGCCACGCCATATTCGGCAGCCCCCGCCGCGCCTCCCCGCCGCTCCTCCACAGCGAGAGCCTCTGCGCCGGCCAGTACTACTACCTCCTCCCCGCGCACAAGGCCGGCCATCGCGCGGCGGCGGAGACGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805862.1
MGNCIFKALGVAVEDMVRVVTPDGGVMELYAPITAECVTNEFPGHAIFGSPRRASPPLLHSESLCAGQYYYLLPAHKAGHRAAAETPAPPYRMSVDNLRRLSEAEVFPRYNTAGVWKVRLVIDTDQLSEILSQEARTEALIESVRTAAKCAAAGAPSAANSDRRSRTSTAVDNSW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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