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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003982`

染色体: Chr04 坐标: 55260556-55264399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003982`
名称	SmilChr04G003982
描述	soluble inorganic pyrophosphatase 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55260556 - 55264399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020847`
GeneID	`131020847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020847`
原始查询	`LOC131020847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	soluble inorganic pyrophosphatase 1-like
产物	soluble inorganic pyrophosphatase 1-like
Arabidopsis	`AT2G46860` (PPa3) pyrophosphorylase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819299] identity=82.2; qcov=0.947; evalue=1.31e-122; confidence=high
Rice	`Os05g0438500` - identity=77.5; qcov=0.981; evalue=1.12e-120; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004427 (inorganic diphosphate phosphatase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006796 (phosphate-containing compound metabolic process)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00719 (Pyrophosphatase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805874.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805874.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805874.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805874.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805874.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55262179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B84
`Chr4:55262182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B84
`Chr4:55263067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B78,C14,C84
`Chr4:55263094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55263112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805874.1

208 aa

104

208

Pyrophosphatase

PF00719 Pyrophosphatase 47-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805874.1`	Pfam	`PF00719`	Pyrophosphatase	Domain	47	198	1.7e-58	197.6	Inorganic pyrophosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949891.1
TATTATGCTAATGCGATTCATTGCCATTAACAATTTTTTTTTTTTTTTGCTTTGTCTCGAGCAGTTTTGTTCTACTAATTCTAAAATTGATCTAAAATGAGCAAGCCGGAAGAATCTAAATCCGGATCTCCCAAGCTGAACAAAAGGATCTTGTCGTCCTTGTCCAAGAGATCGGTCATCGCTCATCTTTGGCACGACATTGAAGTTGGTGCTGAAGCACCTCAGATTCTCAACTGCGTTGTGGAGATAACAAAAGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020847
ATGAGCAAGCCGGAAGAATCTAAATCCGGATCTCCCAAGCTGAACAAAAGGATCTTGTCGTCCTTGTCCAAGAGATCGGTCATCGCTCATCTTTGGCACGACATTGAAGTTGGTGCTGAAGCACCTCAGATTCTCAACTGCGTTGTGGAGATAACAAAAGGGAGTAAAGTGAAGTATGAACTTGACAAGAAAACTGGTCTCATAAAGGTTGATCGTGTTCTATACTCGTCAGTAGTATATCCTCACAACTACGGTTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805874.1
MSKPEESKSGSPKLNKRILSSLSKRSVIAHLWHDIEVGAEAPQILNCVVEITKGSKVKYELDKKTGLIKVDRVLYSSVVYPHNYGFIPRTLCEDNDPIDVLVLMQEPVLPGSMLRVRPIGLMPMIDQGEKDDKLIAVCADDPEYRHYTDIKQLAPHRLMEIRRFFEDYKKNENKEVAVNEFLPPAAALETVQQSIDLYAEYILLTLKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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