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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003990`

染色体: Chr04 坐标: 55307311-55310815 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003990`
名称	SmilChr04G003990
描述	monosaccharide-sensing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55307311 - 55310815 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020850`
GeneID	`131020850`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020850`
原始查询	`LOC131020850`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monosaccharide-sensing protein 2-like
产物	monosaccharide-sensing protein 2-like
Arabidopsis	`AT4G35300` (TMT2) tonoplast monosaccharide transporter2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829684] identity=51.3; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0539900` (TMT1) - identity=52.8; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005366 (myo-inositol:proton symporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020850

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057805877.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057805877.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057805877.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805877.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805877.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55307605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55307611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55307647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C28,C79
`Chr4:55307931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B9,C23
`Chr4:55308139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C73,C80
`Chr4:55308261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B119,C3,C51,C86
`Chr4:55308289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,C73,C80
`Chr4:55308306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:55308715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C53
`Chr4:55308716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B112,B37
`Chr4:55308724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55308755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805877.1

705 aa

352

705

Sugar_tr

MFS_1

Sugar_tr

PF00083 Sugar_tr 7-227 aa PF07690 MFS_1 12-205 aa PF00083 Sugar_tr 484-695 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805877.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	7	227	5.7e-90	303.1	Sugar (and other) transporter
`XP_057805877.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	12	205	4e-18	66.2	Major Facilitator Superfamily
`XP_057805877.1`	Pfam	`PF00083`	Sugar_tr	Family	484	695	5.7e-90	303.1	Sugar (and other) transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949894.1
GCCTGTCCACTCCATGCAAGGTGGCGCTTCACCTCCGTAACGCCACTCATATTTTCCAACTCCCCTCACTCTTCTCTTCGTCTTTCCATTTCCTCAAAAATCCCTTATTCCAACCGAAAAAGCCCTCAATTTTAGCTCCCGCGATGGAAATGTACAATTGGTGCTGTTTGTGATTCACTGCTTCAACAATATTTATCTTTTACATCGTTTTTTGGGTGTTTTTCAGTTCGATTAGAGGTTATAAATTTGTCACAGAAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020850
ATGAATTCGGCTGTGCTCGTAGCCCTAGTCGCCGCCGTCGGCAATTTGATACAAGGATGGGATAACGCCGTCGTCGGAGGCGTGATCGCCCATATAAAAAGGGAATTCAGATGGGAAGACAAACCCAGCATGGTAGGGCTAACAGTGGCCCTGCCGCTGATCGGAGCCACCGTAATCACAATGTGCTCCGGCGGGATCTCCGATTGGGTAGGGCGCCGTCCGATGCTAACCGCCTCCTCCGTCGTGTACATCGTAAGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805877.1
MNSAVLVALVAAVGNLIQGWDNAVVGGVIAHIKREFRWEDKPSMVGLTVALPLIGATVITMCSGGISDWVGRRPMLTASSVVYIVSGVLMLWSPNVYLLLFARLLAGCAIGLAVTFVPMYISEMAPPEVRGLLSTIPQFTYTGGLFAGNAFVFVMSMLGNASSWRLILGILFAPSIVFCALTIFYLPESPRWLLSKGRATEANKALQRLRGKEDVAGEMALLVEGLEVGGGTTIEEYVIGPQGMMDEEEQRAEREELKML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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