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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003989`

染色体: Chr04 坐标: 55303192-55306300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003989`
名称	SmilChr04G003989
描述	mitochondrial phosphate carrier protein 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55303192 - 55306300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020855`
GeneID	`131020855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020855`
原始查询	`LOC131020855`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial phosphate carrier protein 1, mitochondrial
产物	mitochondrial phosphate carrier protein 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G17270` (PHT3;3) phosphate transporter 3;3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816233] identity=66.5; qcov=0.975; evalue=4.84e-157; confidence=high
Rice	`Os02g0767500` (OsPT15) - identity=48.4; qcov=0.965; evalue=1.7e-107; confidence=high
GO	GO:0005315 (phosphate transmembrane transporter activity); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:1990547 (mitochondrial phosphate ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805884.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057805884.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057805884.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805884.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805884.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55303555`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr4:55303555`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr4:55303609`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B124
`Chr4:55303609`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B124
`Chr4:55305145`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A20,B132,B77,C33
`Chr4:55305145`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A20,B132,B77,C33
`Chr4:55305957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr4:55305966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805884.1

315 aa

158

315

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 20-102 aa PF00153 Mito_carr 112-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805884.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	20	102	1.5e-45	153.6	Mitochondrial carrier protein
`XP_057805884.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	112	196	1.5e-45	153.6	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949901.1
AAGATGAATAAATCCCTTCTAATTTTGCGGGTATCAGCATGTAAACGTGGATCAATTTGAGAACAACGACAAAAGCTGATGTAACTGTGGTATATATGCGATCAATTCATACGATATTGGAACAAATCAACAAAGTCCTAATGTCAAATCGTCCCCACTAACCAAACTATATATTAGCTATGAGCCAGCGCTGCTGAATCCGCTTTAACGTCAGATTCTGACAGCATTTTGGGGCGCCGGCGTTTGGGATGGAGGCGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020855
ATGGAGGCGTGGCGGCGGCGGCGCAACATAGAGGAGTTCTCCAAGGGGTATTACGGGGTGTGTGCGGCCGGAGGAATGCTCAGCGCCGGAGCCGCCCATCTCGCCATCACCCCTCTCGATGTGTTGAAGGTTAACATGCAGGTCAATCCGATCAAATATAGTGGCATCATATCAGGGTTTAGCACTCTTTGCAGAGAAGAAGGTGCTTCGGCTCTTTGGAGGGGTTGGTCTGGCAAACTTATTGGTTATGGTGTACAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805884.1
MEAWRRRRNIEEFSKGYYGVCAAGGMLSAGAAHLAITPLDVLKVNMQVNPIKYSGIISGFSTLCREEGASALWRGWSGKLIGYGVQGGCKFGLYEYFKKLYGDVLVNQNKGVIYFLSAASAQVFADVALCPFEAVKVRVQSQPSFANGLADGFPKVYAKEGFYGLYRGLLPLWGRNLPFSMFMFTTFEHSVDLMHRKVIRRKREDCSTAQQLAVTCLAGYSAGIVGAVISNPADNIVSSLYNKKAASIVQAVKKIGLANL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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