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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003994`

染色体: Chr04 坐标: 55329432-55329831 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003994`
名称	SmilChr04G003994
描述	EC protein homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55329432 - 55329831 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020861`
GeneID	`131020861`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020861`
原始查询	`LOC131020861`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	EC protein homolog
产物	EC protein homolog
Arabidopsis	`AT2G23240` (AtMT4b) Plant EC metallothionein-like protein, family 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816856] identity=53.3; qcov=1.05; evalue=8.18e-17; confidence=low
Rice	`Os10g0542100` (OsMT4) - identity=48.7; qcov=0.907; evalue=3.9e-14; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF02068 (Metallothio_PEC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020861

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805890.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805890.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805890.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805890.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55329518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr4:55329527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,A7,B71,B80,B82
`Chr4:55329559`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B103,B44,B51,C17
`Chr4:55329559`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B103,B44,B51,C17
`Chr4:55329571`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A22,B66,B87
`Chr4:55329571`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A22,B66,B87
`Chr4:55329573`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A22,B87
`Chr4:55329573`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A22,B87
`Chr4:55329593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:55329622`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A18
`Chr4:55329622`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A18
`Chr4:55329683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B64,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805890.1

86 aa

Metallothio_PEC

PF02068 Metallothio_PEC 11-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805890.1`	Pfam	`PF02068`	Metallothio_PEC	Domain	11	85	5.1e-21	75.5	Plant PEC family metallothionein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949907.1
ATATATCTAACCATGCAATAGCTGAATTGAAAGAAATTAATGGCGGACATGCGAGGACGCGGCGTGGTGTGCGACGACAGGTGCGGCTGCCCGTCGCCGTGCCCCGGCGGGGCGGCGTGTAGCTGCGCGGGAGGAGGAGGAGCGGCGGAGGAATCCGCCGTGGACCACAAGAAGTGCCCGTGCGGGGAGCACTGCGGGTGCAACCCCTGCACGTGCACCTCCGCCGCCCAGAGCGCCGGCACCGGCAAGGCGCACTGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020861
ATGGCGGACATGCGAGGACGCGGCGTGGTGTGCGACGACAGGTGCGGCTGCCCGTCGCCGTGCCCCGGCGGGGCGGCGTGTAGCTGCGCGGGAGGAGGAGGAGCGGCGGAGGAATCCGCCGTGGACCACAAGAAGTGCCCGTGCGGGGAGCACTGCGGGTGCAACCCCTGCACGTGCACCTCCGCCGCCCAGAGCGCCGGCACCGGCAAGGCGCACTGCAGGTGCGGCGCCGGCTGCACGTGCCCTACTTGCGCGGCCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805890.1
MADMRGRGVVCDDRCGCPSPCPGGAACSCAGGGGAAEESAVDHKKCPCGEHCGCNPCTCTSAAQSAGTGKAHCRCGAGCTCPTCAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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