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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003995`

染色体: Chr04 坐标: 55330438-55332936 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003995`
名称	SmilChr04G003995
描述	uncharacterized SmilChr04G003995
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55330438 - 55332936 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020862`
GeneID	`131020862`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020862`
原始查询	`LOC131020862`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transport/golgi organization-like protein (DUF833) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829983]; symbol=AT4G38260; hit=AT4G38260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	transport/golgi organization-like protein (DUF833) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829983]; symbol=AT4G38260; hit=AT4G38260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G38260` (AT4G38260) transport/golgi organization-like protein (DUF833) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829983] identity=51.8; qcov=1.02; evalue=1.6e-101; confidence=high
Rice	`Os09g0323500` - identity=48.9; qcov=0.993; evalue=1.46e-86; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05742 (TANGO2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020862

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805891.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805891.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057805891.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805891.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805891.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55330630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B137,B28,C79,C83
`Chr4:55330750`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr4:55330750`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr4:55330753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B49,B79,D4
`Chr4:55330884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr4:55330998`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	40	A10,A20,A21,A4,B102,B122,B126,B13,B131,B135,B40,B41,B49,B5,B60,B70,B77,B86,B90,B92,C11,C15,C20,C23,C4,C40,C41,C49,C5,C64,C66,C69,C7,C75,C76,C80,D10,D7,D8,D9
`Chr4:55331003`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	40	A10,A20,A21,A4,B102,B122,B126,B13,B131,B135,B40,B41,B49,B5,B60,B70,B77,B86,B90,B92,C11,C15,C20,C23,C4,C40,C41,C49,C5,C64,C66,C69,C7,C75,C76,C80,D10,D7,D8,D9
`Chr4:55332100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B26,B68,C21,D11
`Chr4:55332191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A16,B136,B26,B4
`Chr4:55332240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D11
`Chr4:55332457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B26,B84,C21,D11
`Chr4:55332510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B15,B66,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805891.1

268 aa

134

268

TANGO2

PF05742 TANGO2 1-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805891.1`	Pfam	`PF05742`	TANGO2	Family	1	248	4.9e-72	243.8	Transport and Golgi organisation 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949908.1
TCTTGTGGTTGAATATTTAATTTTGTGAAGAGTAAAAGGAAGTTTCAACATGAAGAGACTATATGGTCAATCTAAAGAATTCCCAATTCATAAGCCCTAATTTTATAATTTCAACCCAAAATCTTCAGAAACACAAATATGTGCATAGCTGTGTTCGCATGGAAATTTCACCCAATCTACCCCTTCATTTTACTGCTCAACAGAGACGAGAACTACAATCGGCCGACGACGCCGTTGGGGTGGTGGCAGAACGGCTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020862
ATGTGCATAGCTGTGTTCGCATGGAAATTTCACCCAATCTACCCCTTCATTTTACTGCTCAACAGAGACGAGAACTACAATCGGCCGACGACGCCGTTGGGGTGGTGGCAGAACGGCTCAATACTCGGCGGAAGAGATGGTCAGGCCGGCGGAACCTGGCTGGCTTGCAGCAGGGACGGGAAGCTTGCGTTTCTCACCAACGTCAGGGAAGCCCCACCCCGTCCACAGCTCAAAAGCAGAGGAGATCTCCCCGTTCGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805891.1
MCIAVFAWKFHPIYPFILLLNRDENYNRPTTPLGWWQNGSILGGRDGQAGGTWLACSRDGKLAFLTNVREAPPRPQLKSRGDLPVRFFTSRKSPKEFGEEVMEEANQFNGFNLIVADLCSMSMVYITNRPMDGDLCVKEVSSGIHVLSNAKLDTPWPKAERLRRGFADVLGKFSEAEISLKEITKMVMNDTTKDESELPGIYSREFEYCASAIFVEADTALGRYGTRSTSAVVLTTGGAVTFYETYLENDAWRDRTVNFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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