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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003998`

染色体: Chr04 坐标: 55345698-55349426 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003998`
名称	SmilChr04G003998
描述	protein NLP2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55345698 - 55349426 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020865`
GeneID	`131020865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020865`
原始查询	`LOC131020865`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NLP2-like
产物	protein NLP2-like
Arabidopsis	`AT1G20640` (AT1G20640) Plant regulator RWP-RK family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838653] identity=40.7; qcov=1.07; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os09g0549450` - identity=39.4; qcov=1.09; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00564 (PB1); PF02042 (RWP-RK); PF22922 (GAF_NLP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805893.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805893.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805893.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805893.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805893.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55345940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B24
`Chr4:55345941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A4,B49
`Chr4:55345957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B3,C22
`Chr4:55346100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B3,C22,C53,C86
`Chr4:55346110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B89
`Chr4:55346154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr4:55346157`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C78
`Chr4:55346157`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C78
`Chr4:55346246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B127,B136,C47
`Chr4:55346299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B81,B93
`Chr4:55346383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B3,C22
`Chr4:55346522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805893.1

784 aa

392

784

GAF_NLP

RWP-RK

PB1

PF22922 GAF_NLP 93-193 aa PF22922 GAF_NLP 246-417 aa PF02042 RWP-RK 468-541 aa PF00564 PB1 691-771 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805893.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	93	193	3.2e-84	281.5	NLP protein GAF domain
`XP_057805893.1`	Pfam	`PF22922`	GAF_NLP	Domain	246	417	3.2e-84	281.5	NLP protein GAF domain
`XP_057805893.1`	Pfam	`PF02042`	RWP-RK	Domain	468	541	5.5e-25	88.0	RWP-RK domain
`XP_057805893.1`	Pfam	`PF00564`	PB1	Domain	691	771	4.3e-16	59.3	PB1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949910.1
TAATCCATTATATTCTTACAATCTCACTTTTCCCCATCATTAACTGTATCATTTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCAGAGAGAGAGAAAATTAATGGTTGTATTACTGAACTTTTTGCTGTGGATGATGGACTCATTAGAATTATGAGAGCTGGAAATAACTCGCCATTGATGATGTTTGGCGCGCGCGTGATCGGTTTCTGGAAGATGATGGAAAGCAATCCTCCATGGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020865
ATGGCGGATGGCGCCTTGTCACCTAATATCTCCGACAGCGCCATAGATTTCGATCTCATACACGAACTCTTCCTCGATGGATTCTGGTTAGAGGCCAATAGCTATCAACAACAACATCATCGTCAACCTCAACAACAACAAGAATATTTCTCTAAACCAATTTTCTTTCCACATCCAACAATGGATGAAAGTCTCTCCAGCCATGGAAACTGCGTGAAGCAGAGGCTGGCGCAAGCCATCAATTTCCTCAAAGAGTCGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805893.1
MADGALSPNISDSAIDFDLIHELFLDGFWLEANSYQQQHHRQPQQQQEYFSKPIFFPHPTMDESLSSHGNCVKQRLAQAINFLKESMRDEDVLVQIWIPVKKQGRQVLTASNQPFSLHPSCKDLASYRDACLSYHLVADDDDDELVGLLGRVFLRRLPEWTPDVRFFRREEYPRVGHAQKCNVRASLALPLLEHGGGGACLGVLELVSTHRKLDFHPELHNVCKALEAVDLKSSNIVSSYNVEERDGSYRGALAEIRGAM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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