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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004004`

染色体: Chr04 坐标: 55387782-55391064 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004004`
名称	SmilChr04G004004
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55387782 - 55391064 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020873`
GeneID	`131020873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020873`
原始查询	`LOC131020873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
产物	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT2G17110` (AT2G17110) DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816215] identity=42.1; qcov=1.08; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os09g0547300` - identity=38.5; qcov=0.829; evalue=7.06e-122; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805903.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805903.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805903.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805903.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805903.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55388022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr4:55388031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr4:55388070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B70,B86,C64,C66,C9
`Chr4:55388139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C14,C32,C68
`Chr4:55388223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:55388313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C42
`Chr4:55388316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr4:55388427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr4:55388587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr4:55388802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B7,C30,C37
`Chr4:55388946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55389213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805903.1

701 aa

350

701

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 294-595 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805903.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	5.8e-24	84.7	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057805903.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	294	595	4.6e-99	332.4	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949920.1
ATCAACTCCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCGCTCTCTCCACTCCCGCTGCTATCCGACGCCACTCTCCCCGCTGGCAAAACCGATAAAAACAAAACCACAGAGCAAAAAAAAAGAAAAAGATTCCTCTCCTTTTCCGCCACACCCACAATCCTTTTCTCCTCCTCCACCACCGCCATGCCGCTTTAGCCCAAAACAAAATTCCACTACTCTTCCCCACCATATTCACTCCTCTCATGGGCTGCGCCACCTCCAAGCTCGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020873
ATGGGCTGCGCCACCTCCAAGCTCGACGATTCCCCGGCGGTGGCGCTGTGCCGCGACCGCTGCGCCTCCCTCGACGAGGCCGTGCGCCGCCGCTTCGCCTTCGCGGAGGCGCACGCCGCGTACCTCCACTCCCTCAACGCCGTCGGCCTCTCCCTCGACCGCTTCTTCAGCCACGATCCCCTCCTCGCCGCCGATTCCGCTCCCCCGCTCCTCAACCTCCCGCCGCGGAGGAAGGGATCCGATTCCGGCTCGCATCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805903.1
MGCATSKLDDSPAVALCRDRCASLDEAVRRRFAFAEAHAAYLHSLNAVGLSLDRFFSHDPLLAADSAPPLLNLPPRRKGSDSGSHLRFRSDSDSDDEENASANSESSSRQHDVTPPDHAGLNLNLNLNYMRNQTTPSVAHTQLPMSAETMQIDSHRNFFNGYSNYGGGGGFLGDSSAPAPSSASTSNNAPPPPPSPPRSSTWDFLNPFETVEKFYPAYTSSHDSREVREEEGIPDLEEDADDDDGDAVVVKLVDLAPPRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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