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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004006`

染色体: Chr04 坐标: 55405035-55406062 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004006`
名称	SmilChr04G004006
描述	uncharacterized SmilChr04G004006
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55405035 - 55406062 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020875`
GeneID	`131020875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020875`
原始查询	`LOC131020875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT4G35200; symbol=AT4G35200; hit=AT4G35200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT4G35200; symbol=AT4G35200; hit=AT4G35200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G35200` (AT4G35200) - identity=36.1; qcov=0.976; evalue=1.45e-34; confidence=medium
Rice	`Os08g0551900` - identity=29.4; qcov=1.01; evalue=6.12e-20; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805905.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805905.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805905.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805905.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55405207`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B104,B34,B86,D6
`Chr4:55405310`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C50
`Chr4:55405322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B51,B61,B67
`Chr4:55405328`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr4:55405328`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr4:55405356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:55405419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr4:55405535`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	108	A1,A10,A13,A15,A19,A20,A23,A25,A4,A6,B100,B103,B109,B113,B117,B120,B121,B122,B129,B13,B131,B134,B135,B138,B140,B18,B24,B25,B3,B33,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B49,B51,B52,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B65,B67,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B83,B86,B89,B90,B91,B92,B93,B98,B99,C13,C14,C16,C18,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C27,C3,C31,C32,C33,C37,C38,C40,C49,C5,C56,C59,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C74,C76,C79,C8,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr4:55405541`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	110	A1,A10,A13,A15,A19,A20,A23,A25,A4,A6,B100,B103,B109,B113,B117,B120,B121,B122,B129,B13,B131,B134,B135,B138,B140,B18,B24,B25,B3,B33,B38,B39,B4,B41,B45,B46,B49,B51,B52,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B65,B67,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B83,B86,B89,B90,B91,B92,B93,B98,B99,C13,C14,C16,C18,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C27,C3,C31,C32,C33,C37,C38,C40,C49,C5,C56,C59,C60,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C72,C74,C76,C79,C8,C80,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr4:55405623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805905.1

287 aa

144

287

BPS1

PF03087 BPS1 60-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805905.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	60	284	2.8e-56	191.7	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949922.1
ACAACACATTTCTCATCAAAAAAAGCCAAAAAAAAAAATGGCATCATCAAATTCAAAAGCCCTTCACCACAACCGCTCTCTTAGCTTCCCTTCCAAAGAGAATCCATCAACCTCTCATCTCAATGAGAGCTTGGCCAATGCAAGAGGCCGCGACGCCGCCGCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGTTGTCATCGATGAAGACCAGAGCGAAATGCATCACGAATTTGTACAACGACATCGACGATCTCCTTCAAATGCCCCACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020875
ATGGCATCATCAAATTCAAAAGCCCTTCACCACAACCGCTCTCTTAGCTTCCCTTCCAAAGAGAATCCATCAACCTCTCATCTCAATGAGAGCTTGGCCAATGCAAGAGGCCGCGACGCCGCCGCCTCCTCCTCCTCTTCCTCGTTGTCATCGATGAAGACCAGAGCGAAATGCATCACGAATTTGTACAACGACATCGACGATCTCCTTCAAATGCCCCACACTCACCACATCATCACCCAAGAGAGGTCGATCGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805905.1
MASSNSKALHHNRSLSFPSKENPSTSHLNESLANARGRDAAASSSSSSLSSMKTRAKCITNLYNDIDDLLQMPHTHHIITQERSIDHLLDGYIGVLDACTAAKDLVSNTKHDVQGLLSALRRKDAAGIASYLASTKLSRKSIHKSLKQLRSCRSNKHMICNNNLPKCGESELVHKLKEAESVAIAMLESLMSYLGGNKMQAASKSGWSLVTKVMLSKKREDSDSDSDSDSNEFKKIDALLQKSLEGMQVMNLSKEVDSSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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