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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004007`

染色体: Chr04 坐标: 55408139-55409734 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004007`
名称	SmilChr04G004007
描述	uncharacterized SmilChr04G004007
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55408139 - 55409734 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020877`
GeneID	`131020877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020877`
原始查询	`LOC131020877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G17070; symbol=AT2G17070; hit=AT2G17070; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT2G17070; symbol=AT2G17070; hit=AT2G17070; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G17070` (AT2G17070) - identity=32.2; qcov=1.09; evalue=2.33e-25; confidence=low
Rice	`Os08g0553000` - identity=26.2; qcov=0.992; evalue=1.65e-10; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805906.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805906.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057805906.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805906.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55408176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:55408193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C4
`Chr4:55408193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr4:55408443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B60,C80
`Chr4:55408447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr4:55408449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C47,C76,D8
`Chr4:55408501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:55408523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C14,C32,C68
`Chr4:55408533`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A3,B110,B113,B12,B126,B57,B81,B82,C18,C61,D2,D3
`Chr4:55408870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805906.1

254 aa

127

254

BPS1

PF03087 BPS1 47-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805906.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	47	251	7.4e-38	131.4	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949923.1
ATGGCCCTTCAACAACACACACGTTCTCATAGCTTTCCTAGTGGATCATCATCACAACAAGATGCCATGATTCAAGTTGATGAGAGCTTGCTTTGTGGATCAACTCCTTCATCCTCATCCTCTGCAAAAAACAGAGTAAACAGCCTTCAAAAACTACACGAGAGCATCAACGGCTTGCTTCTGCTGCCTCACATTCAACGAGCCATCGCCCGCGAATGCCCACGTCTCGATGAGATCACGGAAGGGTACGTCGTGGCGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020877
ATGGCCCTTCAACAACACACACGTTCTCATAGCTTTCCTAGTGGATCATCATCACAACAAGATGCCATGATTCAAGTTGATGAGAGCTTGCTTTGTGGATCAACTCCTTCATCCTCATCCTCTGCAAAAAACAGAGTAAACAGCCTTCAAAAACTACACGAGAGCATCAACGGCTTGCTTCTGCTGCCTCACATTCAACGAGCCATCGCCCGCGAATGCCCACGTCTCGATGAGATCACGGAAGGGTACGTCGTGGCGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805906.1
MALQQHTRSHSFPSGSSSQQDAMIQVDESLLCGSTPSSSSSAKNRVNSLQKLHESINGLLLLPHIQRAIARECPRLDEITEGYVVALDACAAAGDVVSAAKRDAQELLSGVRRRHAEAAASSYLASRRELRKVARTQKWLKKIGKRQSLGKGCEIEQLMMDAKSATLATLSCVFSYVVSSERKLVGSKRAEQTEFTKVDAALIAFMNNGDGDMIRDDHLLRVMESSIRVVEEGLECLFRQLIKTRVLLLNVLSH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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