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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004033`

染色体: Chr04 坐标: 55582644-55585469 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004033`
名称	SmilChr04G004033
描述	monooxygenase 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55582644 - 55585469 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020901`
GeneID	`131020901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020901`
原始查询	`LOC131020901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monooxygenase 2-like
产物	monooxygenase 2-like
Arabidopsis	`AT5G05320` (AT5G05320) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830414] identity=49.6; qcov=1; evalue=1.09e-143; confidence=high
Rice	`Os03g0153900` - identity=50.5; qcov=0.998; evalue=5.35e-136; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF00890 (FAD_binding_2); PF01266 (DAO); PF01494 (FAD_binding_3); PF05834 (Lycopene_cycl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057805929.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057805929.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805929.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805929.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805929.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55584123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B17,B44,B51,C1
`Chr4:55584123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B44,B51,C1
`Chr4:55584167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B31
`Chr4:55584200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B9,C8,D2
`Chr4:55584405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr4:55584441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr4:55584476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C79
`Chr4:55584477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:55584794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:55584814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,C48,C85
`Chr4:55584864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C8
`Chr4:55584919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805929.1

403 aa

202

403

FAD_binding_2

DAO

Lycopene_cycl

FAD_binding_3

PF00890 FAD_binding_2 3-39 aa PF01266 DAO 3-53 aa PF05834 Lycopene_cycl 3-160 aa PF01494 FAD_binding_3 3-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805929.1`	Pfam	`PF00890`	FAD_binding_2	Domain	3	39	9.8e-05	22.4	FAD binding domain
`XP_057805929.1`	Pfam	`PF01266`	DAO	Domain	3	53	1.9e-08	35.0	FAD dependent oxidoreductase
`XP_057805929.1`	Pfam	`PF05834`	Lycopene_cycl	Family	3	160	7.2e-08	32.6	Lycopene cyclase protein
`XP_057805929.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	3	323	1.2e-22	81.3	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949946.1
TCATGTGTGCATTAGATGGAAAACAAAGCTTCAAGCTTTTGAATATTCAATTCAAAACAAATTCAAGTGCTCTGCATTTCCCCATTTTCAATCTTCTTCACCAGAAGATTATTCGCACCTGAGCTTCATCTCATCTTCCGCTGCTAGCTAGTATTTAAAGGCTACGCACAGAAATGAATCAAAATCAAATCGAATTGAACAATGGAAGACGTAGTGATTGTTGGCGCTGGAATTGCTGGTCTCGCGACATCTCTGTCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020901
ATGGAAGACGTAGTGATTGTTGGCGCTGGAATTGCTGGTCTCGCGACATCTCTGTCACTACACAGATTGGGGATCCGAAGCTTAGTTTTGGAATCAGCTGATAATATCAGAACCACAGGATTTGCCCTCGGAATCTGGCCTAATGGTTGGAGGGCGCTAGACGCCATTGGCGTAGGCGAAATCCTTCGTGCCAAACACACAAGAATTACAGGAGTAGTGACTACCTCTGTTGATTCTGGAGTTATAACATCGGAGGGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805929.1
MEDVVIVGAGIAGLATSLSLHRLGIRSLVLESADNIRTTGFALGIWPNGWRALDAIGVGEILRAKHTRITGVVTTSVDSGVITSEGTLATSDSNVDREARCVIRKEMLETLESELPRGVIRYSSKVVHIESQDGVNSIHLADGTLLKAKVLIGCDGVNSVVSKFLGFSKPSFTARCGIRGIVHFEEGHGFKPRIMQFFGKGIRFGVVPCDDHRVYWGSTFTPSSQEKEILEDPARLKQFMLSKLGKVPDEIKQVFEKSEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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