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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004035`

染色体: Chr04 坐标: 55591760-55593636 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004035`
名称	SmilChr04G004035
描述	uncharacterized SmilChr04G004035
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55591760 - 55593636 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020903`
GeneID	`131020903`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020903`
原始查询	`LOC131020903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0541500; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os09g0541500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G20930` (AT2G20930) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816627] identity=87.1; qcov=0.979; evalue=1.12e-90; confidence=high
Rice	`Os09g0541500` - identity=86.2; qcov=0.965; evalue=2.61e-92; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030008 (TRAPP complex)
KEGG	-
Pfam	PF04099 (Sybindin); PF04628 (Sedlin_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020903

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805931.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057805931.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057805931.1`
4	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057805931.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057805931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55592033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:55592488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B17,B44,B51,C1
`Chr4:55592495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr4:55593348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B41,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805931.1

143 aa

143

Sedlin_N

Sybindin

PF04628 Sedlin_N 7-135 aa PF04099 Sybindin 20-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805931.1`	Pfam	`PF04628`	Sedlin_N	Family	7	135	8.8e-37	126.8	Sedlin
`XP_057805931.1`	Pfam	`PF04099`	Sybindin	Family	20	136	2.1e-08	35.0	Sybindin-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949948.1
AATCTAAGTTATGGGGGTCAAAAATGTAAACCCTCACAATCCTTGTGGATTAAAAAGCAATTTTTATCTTTGTTGATTCTCTCTCTAAAACAGCGAAGAATCAGAGCTGAAAAATCGCAGCGGAAGCAATGATCGTCTGCCTCGCCGTCGTCGGCCACCAGAATAATCCGTTATACATACAAAGTTTTACTGAATCAGATGATGCGCTCAAGCTTCATCATATAGTCCATTGCTCTCTCGACGTCATCGATGAAAGAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020903
ATGATCGTCTGCCTCGCCGTCGTCGGCCACCAGAATAATCCGTTATACATACAAAGTTTTACTGAATCAGATGATGCGCTCAAGCTTCATCATATAGTCCATTGCTCTCTCGACGTCATCGATGAAAGAGTGAACAACCCCAAAAAGTCCAGCCCAACGATAAACGAGGCATTCCTCGGTCTGCTATATCCAACTGAAAACTACAAAGTATATGGTTACTTGACCAATACTAAGGTGAAGTTCATATTGGTGACGACAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805931.1
MIVCLAVVGHQNNPLYIQSFTESDDALKLHHIVHCSLDVIDERVNNPKKSSPTINEAFLGLLYPTENYKVYGYLTNTKVKFILVTTDLDVRDADVRNFFRRFHAAYVDAVSNPFHIPGKKITSRTFAERVSTIVKSFGLSSAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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