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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004039`

染色体: Chr04 坐标: 55612476-55614111 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004039`
名称	SmilChr04G004039
描述	probable aquaporin PIP2-8
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55612476 - 55614111 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020908`
GeneID	`131020908`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020908`
原始查询	`LOC131020908`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aquaporin PIP2-8
产物	probable aquaporin PIP2-8
Arabidopsis	`AT2G16850` (PIP2;8) plasma membrane intrinsic protein 2;8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816186] identity=90.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0233400` (OsPIP2) - identity=85.5; qcov=1; evalue=8.41e-178; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015250 (water channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020908

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805937.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805937.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805937.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805937.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55612964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B22,B36,B72,C50
`Chr4:55613259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,D10
`Chr4:55613306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:55613346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B60,C12
`Chr4:55613355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr4:55613379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr4:55613418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B98,C51
`Chr4:55613457`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B3
`Chr4:55613457`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B3
`Chr4:55613460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr4:55613594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55613603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B135,B60,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805937.1

283 aa

142

283

MIP

PF00230 MIP 31-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805937.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	31	262	3.8e-84	282.6	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949954.1
ATAATTATTTAATTATTATTAATTAAAACTTTAGAATTAATAATGGGAACACAGATAATAATGAGATATAGAGACACAGAAATGGAATACTGAATAAAACACGTTTTTTATAATTATCACAAAATATATACATTTTTTTTAAAAAAAAATGAGCAAAATTTCGTGTATAACTCCCTCTTTCCACCACTCTTATAAACTCCACCTTCTGCTAAAACCAGACTCCACAATACAGCCAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020908
ATGACGAAGGAAGTGAGCGAAGAGCCGGAGGTCCACCACCACGGGAAGGACTACGTGGACCCGCCGCCGGCGCCGCTGCTCGACTTCGGCGAGCTCAAGCTCTGGTCCTTCTACAGAGCCCTCATCGCCGAGTTCATCGCCACACTCCTCTTCCTCTACGTCACCGTCGCCACCGTCATCGGCCACAAGAAGCTCAACGCTCTCGACCAGTGCGACGGCGTCGGCCTCCTCGGCATCGCCTGGGCCTTCGGCGGCATGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805937.1
MTKEVSEEPEVHHHGKDYVDPPPAPLLDFGELKLWSFYRALIAEFIATLLFLYVTVATVIGHKKLNALDQCDGVGLLGIAWAFGGMIFILVYCTAGISGGHINPAVTFGLFLARKVSLIRAVAYMVAQCLGAICGVGLVKAFMKNPYNRLGGGANVVSSGYNTGTALGAEIIGTFVLVYTVFSATDPKRSARDSHVPVLAPLPIGFAVFMVHLATIPITGTGINPARSFGAAVIYNNSKAWDDHWIFWVGPFVGALAAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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