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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004058`

染色体: Chr04 坐标: 55731732-55734176 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004058`
名称	SmilChr04G004058
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 33-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55731732 - 55734176 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020927`
GeneID	`131020927`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020927`
原始查询	`LOC131020927`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 33-like
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 33-like
Arabidopsis	`AT3G06130` (AT3G06130) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819786] identity=62.2; qcov=0.374; evalue=5.15e-47; confidence=low
Rice	`Os11g0147500` - identity=54.6; qcov=0.422; evalue=1.32e-37; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020927

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805961.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057805961.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057805961.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057805961.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057805961.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55731932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr4:55731948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr4:55732047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr4:55732075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:55732091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B44,B47,B59,B68,C79
`Chr4:55732106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B15,B24,B58
`Chr4:55732130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:55732138`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:55732257`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr4:55732257`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr4:55732258`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	39	A10,A20,A3,A9,B106,B110,B119,B124,B126,B127,B131,B137,B26,B31,B52,B56,B73,B77,B9,B94,B96,C23,C30,C33,C44,C47,C51,C52,C54,C57,C59,C6,C67,C72,C73,C80,C83,D10,D8
`Chr4:55732304`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A10,A20,A3,A4,A8,A9,B106,B110,B119,B126,B127,B131,B137,B26,B31,B42,B43,B52,B56,B73,B77,B9,C23,C24,C33,C38,C47,C51,C52,C54,C57,C59,C73,C80,C83,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805961.1

516 aa

258

516

HMA

PF00403 HMA 14-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805961.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	14	69	1.4e-13	51.7	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949978.1
GTGAGAGTGTTTGTTTCCCTTTGCAACAGTCTCTCTCTCTCCTCACTATGTCTCTCTCTCTCTCCAAAACTCTGAAATAGAGGTAGCCCAGAATTCAGCAGGGGAAGTGTTAATGTGGCTTGCAAACAGGGCCTGAATTCCTTCTCTCTCTCCTTTTTCCCTCTTTTGTGAGTTCTGTGAAGGGACTGCACATTATTTTCTTGAAACTATTTCTCACTCAGATCTACCTCTCTCTCTCTCTGCATTACCCTGTTTGTAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020927
ATGAGTAAAGACGAGTTCTTGAAGATCCAGACTTGTGTTCTTAAAGTCAATATACACTGTGATGGCTGCAAGCATAAAGTCAAGAAAATCTTGCAGAAGATTGAAGGTGTATACACTACTAAAATAGACCAGGAGCAAGGGAAGGTGACAGTTTCTGGTAATGTTGATCCAAACACACTGATTAAGAAGCTAATCAAGAATGGGAAGCATGCTGAGTTATGGGGTGCAAAGCCCTCCAACAATAATAACCAAAACCACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805961.1
MSKDEFLKIQTCVLKVNIHCDGCKHKVKKILQKIEGVYTTKIDQEQGKVTVSGNVDPNTLIKKLIKNGKHAELWGAKPSNNNNQNHLNNQFKNMQIDHGGKGGGGGGGGGGKGQGKGGGNNQPKGVGGGGGGGGPPGHNQQLQQQLQQLQQMKGLQDMKMLPQFMKDVKMAAPGNGKGEQNAKSVKFKLPEDEEMSDDDYDDDDFDDDEDDYDDDELDDEMDHAPLGKMKPVMGGPGGMPPGMMMQNMMNGMMKPGGGGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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