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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004060`

染色体: Chr04 坐标: 55745870-55749531 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004060`
名称	SmilChr04G004060
描述	UPF0613 protein PB24D3.06c-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55745870 - 55749531 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020930`
GeneID	`131020930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020930`
原始查询	`LOC131020930`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	UPF0613 protein PB24D3.06c-like
产物	UPF0613 protein PB24D3.06c-like
Arabidopsis	`AT5G19050` (AT5G19050) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832024] identity=74.5; qcov=0.934; evalue=8.13e-180; confidence=high
Rice	`Os07g0211800` (OJ1664_D08.103-1) - identity=66.8; qcov=1.02; evalue=4.5e-173; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08538 (DUF1749)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805963.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057805963.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805963.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805963.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55746243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B106,D2
`Chr4:55746247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,D11
`Chr4:55746392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C59
`Chr4:55746393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A25,B3,B65,C43
`Chr4:55747298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B20
`Chr4:55748980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805963.1

349 aa

174

349

DUF1749

PF08538 DUF1749 68-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805963.1`	Pfam	`PF08538`	DUF1749	Domain	68	333	1.5e-69	235.1	Protein of unknown function (DUF1749)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949980.1
AGTTACAAGGGTTTGAAATTTTTCAACATGCATTTGATTACTAATTGACATAATATTTTCGAACATTGATTAATGTGTAGTATAATGCTATTTTATATAGTATATTTTTCTTATTTATTTTCGAATTTTATTTTTTATTTATTAAGTATGAATAACTCTAGAATTTGCAATTGCAAGAAAAATAAATAATAAGAGGCACATTGGAGAGTAATAAATCACAAGTTTTTGCCAAGAAATATTAATGTTTTTATGTGTTAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020930
ATGGAGAATTCTAATATGAATCTCTCGACGCCATCTTCGATCTCTGCGCCGCCGCAGACGGCGGCGGCGTCGGGCACTTCTTGGTTTTCCGGCATTGTCCGCAGCCGCTCCACCTCCGCCAAGGCGCCCAACAACATCTCAGCCGCCGCTGGCGACGGCGCCGGAGGTGGAGAAGGACCCATCAACAAGAAGCGTCAATTTCGCGGGGTGATGTTCAAGTACGGGACAGAACCAATTCAGGTTGCTTTCAAAACAGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805963.1
MENSNMNLSTPSSISAPPQTAAASGTSWFSGIVRSRSTSAKAPNNISAAAGDGAGGGEGPINKKRQFRGVMFKYGTEPIQVAFKTGDYKQQVIFIGGLTDGFLATEYLEPLAIALEKERWSLVQFLFSSSYSGYGISSLKRDAKELDQLISYLINKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVYYLRTNAACSRAVRAAILQAPASDREYRATLPETASMIDLASTMINEGRGSELMPREANPDSPITAYRFHSLCAYNGDDDMFSSD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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