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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004063`

染色体: Chr04 坐标: 55771626-55774360 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004063`
名称	SmilChr04G004063
描述	putative transferase At4g12130, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55771626 - 55774360 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020933`
GeneID	`131020933`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020933`
原始查询	`LOC131020933`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative transferase At4g12130, mitochondrial
产物	putative transferase At4g12130%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G12130` (AT4G12130) Glycine cleavage T-protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826821] identity=64.7; qcov=0.828; evalue=2.31e-172; confidence=high
Rice	`Os06g0134800` - identity=58.8; qcov=0.828; evalue=5.79e-147; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005759 (mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF25455 (Beta-barrel_CAF17_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020933

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805965.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057805965.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805965.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805965.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805965.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55771850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D10
`Chr4:55771853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C63
`Chr4:55771918`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A4,B100,B106,B113,B114,B117,B135,B19,B2,B26,B3,B45,B47,B48,B5,B53,B55,B60,B63,B67,B69,B73,B75,B83,B85,B86,C16,C21,C22,C25,C31,C32,C36,C38,C4,C41,C44,C48,C54,C59,C63,C68,C71,C73,C80,C81,C84
`Chr4:55772496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr4:55772702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B13,B33,D10
`Chr4:55772742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B64,C24,C30
`Chr4:55772857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B6,C63
`Chr4:55772888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:55773809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B20
`Chr4:55773827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B50,C37
`Chr4:55774082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B20
`Chr4:55774148`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A14,A16,A20,A22,A6,B118,B119,B140,B22,B26,B28,B33,B36,B47,B50,B51,B53,B60,B63,B66,B69,B7,B71,B76,B91,B94,C17,C27,C3,C38,C45,C50,C53,C63,C71,C74,C78,C80,C84,C86,D11,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805965.1

448 aa

224

448

Beta-barrel_CAF17_C

PF25455 Beta-barrel_CAF17_C 356-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805965.1`	Pfam	`PF25455`	Beta-barrel_CAF17_C	Domain	356	437	4.4e-17	62.3	CAF17, C-terminal beta-barrel domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949982.1
CAACTCGCAAGTTTGAGAGACATTTCATCAAACAGGATAGGCGTCAGCTCAGTGCCGCTGCCACACGTGTTGCCTTCTGATAAACCCCTGCCCACACGTGTTGCCTTCCCCCAAAAACCCCTTACATCTACCGCCGCCGCCGCCGCGAAGGCTGCAGCCGCTCACCTCGCAAGATGCACGGCCTCAGCTCCTCTCTCCGCTTCCTCAGACTTCTTCTCAGCTCAGACTAACCTCAGCTCCGCCGGCCCCATGGCGTGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020933
CAACTCGCAAGTTTGAGAGACATTTCATCAAACAGGATAGGCGTCAGCTCAGTGCCGCTGCCACACGTGTTGCCTTCTGATAAACCCCTGCCCACACGTGTTGCCTTCCCCCAAAAACCCCTTACATCTACCGCCGCCGCCGCCGCGAAGGCTGCAGCCGCTCACCTCGCAAGATGCACGGCCTCAGCTCCTCTCTCCGCTTCCTCAGACTTCTTCTCAGCTCAGACTAACCTCAGCTCCGCCGGCCCCATGGCGTGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805965.1
QLASLRDISSNRIGVSSVPLPHVLPSDKPLPTRVAFPQKPLTSTAAAAAKAAAAHLARCTASAPLSASSDFFSAQTNLSSAGPMACLLKTRSVIRFRGPETLKFLQGLVTNDVRSLDDPHSVAENAATPNMPAVAAAPVYAAMLTPQGRFLYDFFLYRPPRADEKLDATGSGPGPDSGELEIYADVDGSVVDELLAALKKFRLRSKVDIENVGEEFSCWQRFSWDLEGKSSSQEEPEADSVGWGGTVDQSGVSASQGNNI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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