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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004071`

染色体: Chr04 坐标: 55800261-55804382 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004071`
名称	SmilChr04G004071
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 7-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55800261 - 55804382 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020941`
GeneID	`131020941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020941`
原始查询	`LOC131020941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 7-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 7-like
Arabidopsis	`AT3G06250` (FRS7) FAR1-related sequence 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819799] identity=58.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0655600` - identity=34.5; qcov=0.829; evalue=1.18e-113; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805975.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805975.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805975.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805975.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55800498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:55800546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:55800571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C38
`Chr4:55800643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr4:55800651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B67,C17,D11
`Chr4:55800661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr4:55800795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C70
`Chr4:55800849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr4:55800870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C38
`Chr4:55801029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,A24,A5,B132
`Chr4:55801150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr4:55801173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B89,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805975.1

772 aa

386

772

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 52-126 aa PF03101 FAR1 204-278 aa PF10551 MULE 381-473 aa PF04434 SWIM 665-691 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805975.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	52	126	2.9e-39	134.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057805975.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	204	278	2.9e-39	134.4	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057805975.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	381	473	4.2e-26	91.9	MULE transposase domain
`XP_057805975.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	665	691	4.3e-08	33.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949992.1
AGATTCCATGGACCTCCGTACCACAGTATAGAAACTCTGACGCCCATTTCCAACGACCGTGAAAAGGCGAAACGTACTGAAAATCCACCTCAGCTCAGCATCAACCCCATCTCAGCCCACAAAATCCACTGCTCAAATTTAAATTAATCTCGGAAAGATAAAAACCAATTTATCTTTCGGATTTTGGAGTATTATTTGCTAAACCGGCGTTGATCAATTTTGCGGTTGAAATGATGGGTTTTTCCGCATTGTATTCCAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020941
ATGAATAGGGAAGAGTTGGGTAATATTATGACTGTCAGGACAAAACCAGCAGCTCTAGTTATTCCAAAAAGCAATGGCCACCGAGAAGATGTTGGGCAGTCTAAGATGGAGCCACATGTGGGGTTAGAGTTTGATTCGGCTGAAGAGGCGCAGGAGTTCTATAGTTCCTACGCTACCCAAATTGGGTTCAAGATTAGGATTGGGCAGTTATATAGATCTCGAGTTGACGGTGCTGTTATTTCCCGGAGATTTGTGTGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805975.1
MNREELGNIMTVRTKPAALVIPKSNGHREDVGQSKMEPHVGLEFDSAEEAQEFYSSYATQIGFKIRIGQLYRSRVDGAVISRRFVCSKEGFQTNSRTGCPAFIRVQKVDSGKWVLANIKKEHNHEFEASGELCPPRIQRKTIPTPRSSSAGGASRTGIRSHEDDSPTGVVDMKRLKKEEMDGMVGPVAEPQKGLEFNSANEAYKFYYTYAASAGFRIRIGQLFRSKHDGSITSRRFVCSKEGHQHPSRVGCGAYMRIQRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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