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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004072`

染色体: Chr04 坐标: 55813529-55815622 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004072`
名称	SmilChr04G004072
描述	uncharacterized SmilChr04G004072
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55813529 - 55815622 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020945`
GeneID	`131020945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020945`
原始查询	`LOC131020945`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827225]; symbol=AT4G15520; hit=AT4G15520; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827225]; symbol=AT4G15520; hit=AT4G15520; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G15520` (AT4G15520) tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827225] identity=77; qcov=0.964; evalue=3.2e-117; confidence=high
Rice	`Os05g0141400` - identity=72.2; qcov=0.911; evalue=1.16e-104; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0006396 (RNA processing); GO:0008173 (RNA methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00588 (SpoU_methylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805977.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057805977.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057805977.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805977.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805977.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55813716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr4:55813761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:55814315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82
`Chr4:55814369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B51,D2
`Chr4:55814373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:55815243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:55815270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805977.1

225 aa

112

225

SpoU_methylase

PF00588 SpoU_methylase 15-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805977.1`	Pfam	`PF00588`	SpoU_methylase	Family	15	150	1.3e-29	103.9	SpoU rRNA Methylase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949994.1
TGTTAGTCTAAATTCAGATAGGCGAAAGCAATCCCCTAAACCCTTCACACATCCGCCGCCGCCGCTGCCGAATTTCCGGCGGTTTTTGTAGCACGAATCCTTTTGTATACATGGAGAATGAGGACGAGAAGAAGCCGGAAAAATACGAGAGCTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGCGGCACAACGTCGGGACGCTCGCCCGCAGCGCCACCGCTTTCGGGGTGGCGGAGCTGATTTTGGTCGGGCGGCGCGACTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020945
ATGGAGAATGAGGACGAGAAGAAGCCGGAAAAATACGAGAGCTACGTGGTTGTTCACAACATAGCGAAGCGGCACAACGTCGGGACGCTCGCCCGCAGCGCCACCGCTTTCGGGGTGGCGGAGCTGATTTTGGTCGGGCGGCGCGACTTCAACGCCTTCGGCAGCCATGGATCCACCTCGCACGTCCGTTTCCGCCATTTTCACTCCCTCTCACTTGCCCGTACCTATCTCAAGGAGAGGGACTGTGACATATGTGGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805977.1
MENEDEKKPEKYESYVVVHNIAKRHNVGTLARSATAFGVAELILVGRRDFNAFGSHGSTSHVRFRHFHSLSLARTYLKERDCDICGVEITDNAMPVNAHPFRKSTAFLVGNEGTGLSPKECEMCDFFVYIPQYGGGTASLNVTVAASIVLQHFAVWAGFSERTREGNKFLVADRPASSGRKFCEETAESIAEERKLRKESAANGFFSESGSNENPSNLLDSLFDS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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