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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004076`

染色体: Chr04 坐标: 55837091-55840948 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004076`
名称	SmilChr04G004076
描述	serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55837091 - 55840948 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020950`
GeneID	`131020950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020950`
原始查询	`LOC131020950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28
产物	serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28
Arabidopsis	`AT5G18810` (SCL28) SC35-like splicing factor 28 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831999] identity=66.4; qcov=0.49; evalue=1.38e-48; confidence=medium
Rice	`Os03g0363800` - identity=75.8; qcov=0.502; evalue=6.65e-52; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805984.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	1.00000	`XP_057805984.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057805984.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805984.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805984.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55837317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:55838412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	199	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A22,A23,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B105,B107,B110,B111,B114,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B124,B126,B127,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B69,B7,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B99,C1,C10,C11,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C27,C28,C3,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C74,C75,C77,C79,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr4:55840322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B104
`Chr4:55840352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B85,C54
`Chr4:55840433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805984.1

255 aa

128

255

RRM_1

PF00076 RRM_1 41-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805984.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	41	111	1.5e-16	60.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950001.1
GAAAATCTGTAAATAGCGAAATATGAAAGGGGAAATATGCAATTTTCTCCTCTCCCTCCAAAACTTATCTCACACAATAGATAAAGGCGAAGAAATAAAACACTAACGAAACCGACGCCACTCGATTTCTCATTTAGGGTTTCTGATTTTCGCATTCTGAATCGAATTAGGGTTTTGAAACAAGAAATTGCGGCTTAGTTAGGTGATCGGGAGCTGAATTTATGGCGAGGCATCGTAGCAGAAGCGGGAGCCGCGGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020950
ATGGCGAGGCATCGTAGCAGAAGCGGGAGCCGCGGCCGCAGCCGTAGTCCGGCCAGAAGAAAGTTGTACGACGAGCCGCGCGACCGCCGCCGTGATCGTCGCTCGCCAGCTCCTTCCGGTCTCCTCGTTCGAAACATTGCTCTCAGCTCCAGGCCTGAAGACCTGAGGGTTCCCTTTGAAAGATTTGGTCCGGTAAAGGATGTTTATTTGCCGAAAAATTACTATACAGGGGAACCTCGTGGCTTTGGATTCGTCAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805984.1
MARHRSRSGSRGRSRSPARRKLYDEPRDRRRDRRSPAPSGLLVRNIALSSRPEDLRVPFERFGPVKDVYLPKNYYTGEPRGFGFVKFRYPEDAAEAKSHMDRTVIGGREIRIVFAEENRKTPQEMRRVTRTSSRGSHRRRSPSYSPRRRYHSRSHSPSPARHHDSRDRGYGTSDGRYSGHRSRSISRSVSPKDDRSYRSRERRSGPLLRSVSPLDEKNHLPSLHSPSPRENGHPGYAGSRSPTPRRNSLSPISRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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