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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004089`

染色体: Chr04 坐标: 55906720-55908507 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004089`
名称	SmilChr04G004089
描述	CASP-like protein 1E2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	55906720 - 55908507 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020963`
GeneID	`131020963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020963`
原始查询	`LOC131020963`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 1E2
产物	CASP-like protein 1E2
Arabidopsis	`AT4G15630` (AT4G15630) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827240] identity=41.5; qcov=1.01; evalue=4.26e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0363300` - identity=44.2; qcov=0.808; evalue=2.05e-29; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806001.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806001.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806001.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806001.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:55906804`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,A8,B107,B115,B18,B2,B68,B97,C13,C75
`Chr4:55906845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:55906867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B41
`Chr4:55906889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B67,B85,C54
`Chr4:55908161`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A8,B115,B18,B2,B97,C13,C19,C21,C75
`Chr4:55908188`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A2,B1,B105,B126,B133,B138,B25,B33,B54,B81,B92,C25,C3,C35,C38,C45,C49,C57,C58,D8
`Chr4:55908212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C30,C87
`Chr4:55908337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr4:55908342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B129,B56,C81
`Chr4:55908377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B28,B36
`Chr4:55908378`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr4:55908378`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806001.1

193 aa

193

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 28-175 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806001.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	28	175	8.7e-36	123.7	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950018.1
TTTTATTTTAGAATCTCGAAATATATTTTCTCTTATTGAATTATTATTAGCTTCGCAAGAAATGGAATCTCAATACAAGGATAGTGACAATGGAGTTACCAATGGTGGAGAGGAGGAATTTGTAGCGGTGGCTAACAAGAGAAAAATGGTGGGATGGGGTTTGTTTCTGCGTGCGGCGGCGGCGGCGCTCAGCCTAGCAGCAGCGGTGGTTCTCAGCCTTGATAACCAAACGACGATGGTGGCGCTGCGGCCGCGGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020963
ATGGAATCTCAATACAAGGATAGTGACAATGGAGTTACCAATGGTGGAGAGGAGGAATTTGTAGCGGTGGCTAACAAGAGAAAAATGGTGGGATGGGGTTTGTTTCTGCGTGCGGCGGCGGCGGCGCTCAGCCTAGCAGCAGCGGTGGTTCTCAGCCTTGATAACCAAACGACGATGGTGGCGCTGCGGCCGCGGGTGATTGTTCCGGTTACGGCTAAGTGGCATTACTTGTCCGCTTTTGTGTACTTTGTGGTGGCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806001.1
MESQYKDSDNGVTNGGEEEFVAVANKRKMVGWGLFLRAAAAALSLAAAVVLSLDNQTTMVALRPRVIVPVTAKWHYLSAFVYFVVANAIASVYGTISLLLTLASSRGGKRRIVVVVVVSDLVTAALLFSSFGAAAAVGLIGREGNSHVQWRKVCDVFDKFCMQGAAALLLSGGASVMFFTLVVVAIFNLHNKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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