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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004111`

染色体: Chr04 坐标: 56037340-56038404 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004111`
名称	SmilChr04G004111
描述	uncharacterized SmilChr04G004111
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56037340 - 56038404 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020987`
GeneID	`131020987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020987`
原始查询	`LOC131020987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820521]; symbol=AT3G13230; hit=AT3G13230; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820521]; symbol=AT3G13230; hit=AT3G13230; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G13230` (AT3G13230) RNA-binding KH domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820521] identity=78.4; qcov=0.991; evalue=4.6e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0115200` - identity=81.7; qcov=0.916; evalue=1.86e-121; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	-
Pfam	PF22891 (KH_PNO1_2nd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806038.1`
2	Nucleolus	核仁	0.80000	`XP_057806038.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806038.1`
4	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057806038.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806038.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56037623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B129,C38
`Chr4:56037692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:56037695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:56037719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:56037758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:56037787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,D7
`Chr4:56037835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B118,B140,B71,D7
`Chr4:56037886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,D7
`Chr4:56037916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B12,B60,C27,C9
`Chr4:56037965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,D7
`Chr4:56037992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:56038022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B140,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806038.1

215 aa

108

215

KH_PNO1_2nd

PF22891 KH_PNO1_2nd 125-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806038.1`	Pfam	`PF22891`	KH_PNO1_2nd	Domain	125	208	2.7e-35	120.8	Eukaryotic type KH-domain (KH-domain type I)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950055.1
TTCAAAAATATATAATAAAAGCAAATTAATCACAAAATTATTAAAAGATGGGCCCGGTTCGAATTATAATCCTTGCTTATATGGGCTGCAGTAACCAGGACTCCTCTCTCACATATTTGGCCCAAAATAAAAATAAATCATTTTTGAACCCTAGTTGAATTGAACCTTTTAATTGAGCAAATTTTCTCTTCAGTTGAATTGTGTGTGCCGCCTCTCACACCGCTTTTCCTTTCCAAAGCGTCGCCGCCGCCGCCGCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020987
ATGGATGTCGAAGCCGCAGCCGCAGCGCCGCAGAAGCCTACGGTCCTATTCGCACAGAAGCCGAACTTCCGGCCTCTGAAGGCGCACGAAATCTCCGACGGCCAGATCCAGTTCCGCAAAATCTCGGTGCCGCCGCACCGCTACACCCCTCTGAAGAAAGCGTGGCTCGAAATCTACACCCCGATCTACGAGGAGATGAAAATCGACATCCGGATGAATCTCAAGGCGCGCAGGGTCGAGCTCAAGACCCGGCCCGACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806038.1
MDVEAAAAAPQKPTVLFAQKPNFRPLKAHEISDGQIQFRKISVPPHRYTPLKKAWLEIYTPIYEEMKIDIRMNLKARRVELKTRPDTPDASNLQKCADFVHAFMLGFDVIDAVAMLRMDELYVESFEIKDVKTLKGEHLSRAIGRLSGKGGKTKFAIENSTRTRIVIADSKIHMLGSFANIKVARDSLCSLILGSPAAKVYSKLRAVTARLAERF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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