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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004116`

染色体: Chr04 坐标: 56057187-56060150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004116`
名称	SmilChr04G004116
描述	probable acylpyruvase FAHD1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56057187 - 56060150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020991`
GeneID	`131020991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020991`
原始查询	`LOC131020991`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable acylpyruvase FAHD1, mitochondrial
产物	probable acylpyruvase FAHD1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT4G15940` (AT4G15940) Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827276] identity=74.3; qcov=0.987; evalue=2.65e-122; confidence=high
Rice	`Os03g0829000` (FAHD2) - identity=74.3; qcov=0.933; evalue=1.14e-114; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0018773 (acetylpyruvate hydrolase activity)
KEGG	smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01557 (FAA_hydrolase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057806044.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057806044.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806045.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806045.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057806045.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56057652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A8,C63
`Chr4:56057970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B71,C16,C45
`Chr4:56057998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:56058025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B40,B47,B48,B7
`Chr4:56058998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr4:56059512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:56059827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806044.1

256 aa

128

256

FAA_hydrolase

PF01557 FAA_hydrolase 48-244 aa

XP_057806045.1

225 aa

112

225

FAA_hydrolase

PF01557 FAA_hydrolase 17-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806044.1`	Pfam	`PF01557`	FAA_hydrolase	Domain	48	244	8e-63	212.7	Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase C-terminal
`XP_057806045.1`	Pfam	`PF01557`	FAA_hydrolase	Domain	17	213	5.4e-63	213.2	Fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950062.1
GGCGTACCATAATCCAGGGTTCGCTTTTCCCCATTTTTCTATTATTTTACTTTTATTTTTTATTTTGTTAATTTTATTGGGTGAAAAAATATAATTTAGTTGAGTTTTTAAATGAAATATATACATGAGTATGCTTTGCTATATATTTGCACAAAATTTACATTTATTTACATTGATAATAAAGTAGGAATATAATGGACCATTTTTTGCCACATTTTTACAGTTAAACCATAACTTTCAATTTCTATTTTGTGCTAATT...

XM_057950061.1
AGTAATCGGGCGAATGGTACAATCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTACTGATACTTGAACAAGCCGTATAAATGTCTGCTTCCATACTCAGATTATCGCCGCCGTGGAGTAGCGCACTCTTTCGGAGTAGTAAAACCACCAAAACAACACTAAGACATCGGAATATGGCGACGTCAGCGTCGGCGATTCAGAAGCTTCTGACAGTCGGAACCAAAATCATCGGCGTCGGCCGCAACTACGCCGCGCATGCGAAGGAGCTCGGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020991
ATGTCTGCTTCCATACTCAGATTATCGCCGCCGTGGAGTAGCGCACTCTTTCGGAGTAGTAAAACCACCAAAACAACACTAAGACATCGGAATATGGCGACGTCAGCGTCGGCGATTCAGAAGCTTCTGACAGTCGGAACCAAAATCATCGGCGTCGGCCGCAACTACGCCGCGCATGCGAAGGAGCTCGGGAACGCTGTGCCTAAGGAGCCGGTGCTTTTTATGAAGCCGACGACGTCGTATCTGGAGAACGGCGGGAA...

LOC131020991
ATGGCGACGTCAGCGTCGGCGATTCAGAAGCTTCTGACAGTCGGAACCAAAATCATCGGCGTCGGCCGCAACTACGCCGCGCATGCGAAGGAGCTCGGGAACGCTGTGCCTAAGGAGCCGGTGCTTTTTATGAAGCCGACGACGTCGTATCTGGAGAACGGCGGGAAAATTGAGGTGCCGGAGCCGCTGGAGGCGCTGGATCATGAGGTGGAGCTGGCGGTGGTCATAGGTCAACGCGCACGCGATGTGCCGGAGGCGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806044.1
MSASILRLSPPWSSALFRSSKTTKTTLRHRNMATSASAIQKLLTVGTKIIGVGRNYAAHAKELGNAVPKEPVLFMKPTTSYLENGGKIEVPEPLEALDHEVELAVVIGQRARDVPEAAAMDYVGGYALALDMTAREIQSVAKSAGLPWSAAKGQDTFTPISSILPKSMLPDPHNVELWLKVDGEIRQKGSTSDMIFKIPFLISHISSLFTLLEGDVILTGTPKGVGPVKIGQKIEAGITDLLDIHFDVERRSRVIH

XP_057806045.1
MATSASAIQKLLTVGTKIIGVGRNYAAHAKELGNAVPKEPVLFMKPTTSYLENGGKIEVPEPLEALDHEVELAVVIGQRARDVPEAAAMDYVGGYALALDMTAREIQSVAKSAGLPWSAAKGQDTFTPISSILPKSMLPDPHNVELWLKVDGEIRQKGSTSDMIFKIPFLISHISSLFTLLEGDVILTGTPKGVGPVKIGQKIEAGITDLLDIHFDVERRSRVIH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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