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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004123`

染色体: Chr04 坐标: 56085409-56088068 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004123`
名称	SmilChr04G004123
描述	pectinesterase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56085409 - 56088068 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020998`
GeneID	`131020998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020998`
原始查询	`LOC131020998`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase-like
产物	pectinesterase-like
Arabidopsis	`AT3G05610` (AT3G05610) Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819727] identity=41.3; qcov=1.01; evalue=2.27e-153; confidence=medium
Rice	`Os03g0300500` (OsPME10) - identity=37.4; qcov=0.955; evalue=3.01e-124; confidence=medium
GO	GO:0030599 (pectinesterase activity); GO:0042545 (cell wall modification); GO:0046910 (pectinesterase inhibitor activity)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01095 (Pectinesterase); PF04043 (PMEI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057806051.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057806051.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806051.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806051.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56085542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:56085637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B84,C37
`Chr4:56085804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:56085834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr4:56086450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr4:56086593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr4:56086606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr4:56086758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:56086799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D5
`Chr4:56086832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B76
`Chr4:56087212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:56087215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C53,C86,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806051.1

557 aa

278

557

PMEI

Pectinesterase

PF04043 PMEI 46-193 aa PF01095 Pectinesterase 241-530 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806051.1`	Pfam	`PF04043`	PMEI	Domain	46	193	1.4e-28	100.7	Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor
`XP_057806051.1`	Pfam	`PF01095`	Pectinesterase	Repeat	241	530	1.4e-107	359.6	Pectinesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950068.1
AAGTGATAAAAAAAAACTCATAATTAAAAAAAAATGGGGGAGTCATCTTCTAAGAAGGGCCTCATCGCCGCCGTGGCCTCCGTTCTCTTGGTGGCGGCCATCGTTGCCGCCGTCGTCACCACCAGAGGCAGCAGCGAGGAGTCGCCGGATATAGGATCCACCACTAAGTCGGTAGACTCGATCTGCGCCCCGACGATGTACCAAGACACGTGTCGCGCCAGCCTCGCCGACGCCAACACGACCGATCCCAAGCAGCTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020998
ATGGGGGAGTCATCTTCTAAGAAGGGCCTCATCGCCGCCGTGGCCTCCGTTCTCTTGGTGGCGGCCATCGTTGCCGCCGTCGTCACCACCAGAGGCAGCAGCGAGGAGTCGCCGGATATAGGATCCACCACTAAGTCGGTAGACTCGATCTGCGCCCCGACGATGTACCAAGACACGTGTCGCGCCAGCCTCGCCGACGCCAACACGACCGATCCCAAGCAGCTCATCCAAAGGGCGATCGACGTCGCCATCGACAAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806051.1
MGESSSKKGLIAAVASVLLVAAIVAAVVTTRGSSEESPDIGSTTKSVDSICAPTMYQDTCRASLADANTTDPKQLIQRAIDVAIDKVGGALKQSNLLKEAAADPMTKLAFDVCREVLETAVGDLRRSVDRIGAIDEPGMLKGFMADLRTWLSAVITNQDTCVDAFENTTGDTGEKMKKLLKTARELSSNGLAMVTDMSEFVETLQLGDLFGSRKLMAEAEGEGFVNRRLLQATALSVKPTIVVSKDGSGKFKRISDAVAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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