当前解析结果
SmilChr01G001821| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001821 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001821 |
| 描述 | cytochrome P450 94C1 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 33147058 - 33149470 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021013 |
|---|---|
| GeneID | 131021013 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021013 |
| 原始查询 | LOC131021013 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cytochrome P450 94C1 |
| 产物 | cytochrome P450 94C1 |
| Arabidopsis | AT2G27690 (CYP94C1)cytochrome P450, family 94, subfamily C, polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817315] identity=59.8; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os01g0858350- identity=59.8; qcov=0.927; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00067 (p450) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021013 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057806074.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057806074.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057806074.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806074.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806074.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:33147340 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr1:33147406 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:33147494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr1:33147517 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr1:33147536 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C35,C49,C77 |
Chr1:33147611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr1:33147833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A16,B28,B68,C42,D2 |
Chr1:33147958 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr1:33148120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr1:33148128 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 99 | A10,A13,A19,A2,A20,A24,A25,A5,A9,B10,B101,B102,B104,B109,B11,B110,B113,B114,B115,B118,B121,B124,B126,B127,B128,B130,B134,B135,B138,B16,B17,B18,B19,B20,B24,B27,B28,B37,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B48,B51,B54,B57,B62,B63,B65,B67,B7,B8,B83,B84,B86,B90,B92,B93,B97,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C27,C31,C38,C4,C42,C43,C5,C52,C53,C58,C59,C60,C61,C66,C68,C69,C77,C8,C80,C87,D1,D10,D11,D2,D8,D9 |
Chr1:33148130 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 101 | A1,A10,A11,A13,A19,A2,A20,A24,A25,A5,A9,B10,B101,B102,B104,B109,B11,B110,B113,B114,B115,B118,B121,B124,B126,B127,B128,B130,B134,B135,B138,B16,B17,B18,B19,B20,B24,B27,B28,B37,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B48,B51,B54,B57,B62,B63,B65,B67,B7,B8,B83,B84,B86,B90,B92,B93,B97,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C27,C31,C38,C4,C42,C43,C5,C52,C53,C58,C59,C60,C61,C66,C68,C69,C77,C8,C80,C87,D1,D10,D11,D2,D8,D9 |
Chr1:33148132 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 99 | A1,A10,A11,A13,A19,A2,A20,A24,A25,A5,A9,B10,B101,B102,B104,B109,B11,B110,B113,B114,B115,B118,B121,B124,B126,B127,B128,B130,B134,B135,B138,B17,B18,B20,B24,B27,B28,B37,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B48,B51,B54,B57,B62,B63,B65,B67,B7,B8,B83,B84,B86,B90,B92,B93,B97,C10,C11,C13,C14,C15,C18,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C27,C31,C38,C4,C42,C43,C5,C52,C53,C58,C59,C60,C61,C66,C68,C69,C77,C8,C80,C87,D1,D10,D11,D2,D8,D9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057806074.1PF00067
p450 78-471 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057806074.1 |
Pfam | PF00067 |
p450 | Domain | 78 | 471 | 9.6e-57 | 193.5 | Cytochrome P450 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。