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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004137`

染色体: Chr04 坐标: 56171864-56173336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004137`
名称	SmilChr04G004137
描述	uncharacterized SmilChr04G004137
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56171864 - 56173336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021015`
GeneID	`131021015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021015`
原始查询	`LOC131021015`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Glycine-rich protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3771473]; symbol=AT5G49350; hit=AT5G49350; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Glycine-rich protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3771473]; symbol=AT5G49350; hit=AT5G49350; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G49350` (AT5G49350) Glycine-rich protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3771473] identity=50.5; qcov=0.568; evalue=9.67e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0253800` - identity=43.4; qcov=0.589; evalue=2.73e-26; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24865 (DUF7731)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806073.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057806073.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806073.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806073.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806073.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56172023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A2,C41
`Chr4:56172208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:56172285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A2,C41
`Chr4:56172345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:56172348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:56172793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:56172877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:56172892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B33,C16,C55
`Chr4:56172910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11
`Chr4:56172930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B26,B50,B58
`Chr4:56173103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806073.1

192 aa

192

DUF7731

PF24865 DUF7731 63-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806073.1`	Pfam	`PF24865`	DUF7731	Domain	63	161	1e-41	141.6	Domain of unknown function (DUF7731)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950090.1
ATTCTCGACTCTTCCAATGCAAGACACAATGCATATATTGTCATTTCAAAAATGTATCAATTTTTCGAACTCAAGAAGCTTCTTCACTTTTTGGAATGTTAGTTTTGACAAACGGAGAATCAAATTATTAATATGATAAACTTTTATTTTAAAAATATATATATACATATCTATACATAATGTTTGAAATCTTGCTAATTATTAGTTCTAACACTAGCAATGGCACTCACTAGGAATTTGATTCTCCTCGTTTCTACTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021015
ATGGCACTCACTAGGAATTTGATTCTCCTCGTTTCTACTACTATTTGCATCTTCGCTTCCACTTCCAAATACGGGAGAGCGTACGACGGGGATCGTCTAGGCGCGGCGGAAGTGATAGCGGACGACTTCGTGCCGGAAGCGGGAGCCGAGGAAGGAGAGGGAGAAGACGAAGGCCATGATCACCCCGATCAAGTCTTCATGGAAGCCCTAGAATGCTTCAACGACAGAAACATCTACAGCGGCTGCGCCGAGGAATACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806073.1
MALTRNLILLVSTTICIFASTSKYGRAYDGDRLGAAEVIADDFVPEAGAEEGEGEDEGHDHPDQVFMEALECFNDRNIYSGCAEEYRLTRHGELHVPRDCADQYCEGPCRKETNLVLECIDEILHHFRFYNKATVGDVRETINAACSYGPKRGDFNVLEHVRVDEDISSKLMCAHSSFHAAVLMMLGWHVLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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