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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004146`

染色体: Chr04 坐标: 56201896-56203092 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004146`
名称	SmilChr04G004146
描述	probable bifunctional TENA-E protein
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56201896 - 56203092 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021025`
GeneID	`131021025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021025`
原始查询	`LOC131021025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable bifunctional TENA-E protein
产物	probable bifunctional TENA-E protein
Arabidopsis	`AT3G16990` (AT3G16990) heme oxygenase-like, multi-helical [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820955] identity=61.3; qcov=0.982; evalue=3.23e-100; confidence=high
Rice	`Os03g0306900` - identity=54.4; qcov=0.973; evalue=8.97e-86; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil00730 (Thiamine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03070 (TENA_THI-4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806086.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806086.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057806086.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806086.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56202095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A15,B94,C62
`Chr4:56202095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B94,C62
`Chr4:56202101`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B122,B3,B89,C18,C43
`Chr4:56202101`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B122,B3,B89,C18,C43
`Chr4:56202104`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A15,B104,B23,B94,C32,C62,C68
`Chr4:56202217`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A10,A14,A15,A7,B104,B105,B109,B114,B115,B117,B121,B127,B132,B133,B137,B14,B22,B23,B26,B28,B34,B36,B46,B50,B54,B60,B64,B65,B66,B68,B72,B73,B76,B79,B88,B9,B93,B94,B99,C14,C15,C22,C23,C26,C27,C30,C32,C34,C36,C37,C41,C49,C5,C53,C57,C61,C62,C66,C68,C70,C82,C86,C87,D4
`Chr4:56202241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr4:56202246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr4:56202253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B28,C33
`Chr4:56202404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:56202985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806086.1

221 aa

110

221

TENA_THI-4

PF03070 TENA_THI-4 12-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806086.1`	Pfam	`PF03070`	TENA_THI-4	Family	12	219	1.7e-41	143.0	TENA/THI-4/PQQC family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950103.1
TGTGTTACTAAACAGATAAAGTCACATAAATTTGTGTCTTTCTTTCCTCTCACTAAAGCTAAGCACGAGAGAAGAAAATGGAGAGATCGGCGATAACGGAGACGTGGCTGAGGAAGCACCGTCAGATCTACCAGCGAGCAACTCGGCACCCTTTCATCCTCTCAATCCGCGACGGCTCCCTTCATCTCTCCTCCTTCAAGCGCTGGCTGGGTCAGGATTATGTGTTTGTGAGAGCATTTGTGCCTTTTATTGCTAGCATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021025
ATGGAGAGATCGGCGATAACGGAGACGTGGCTGAGGAAGCACCGTCAGATCTACCAGCGAGCAACTCGGCACCCTTTCATCCTCTCAATCCGCGACGGCTCCCTTCATCTCTCCTCCTTCAAGCGCTGGCTGGGTCAGGATTATGTGTTTGTGAGAGCATTTGTGCCTTTTATTGCTAGCATATTGCTGAAAGCTTGGAAGGAAAGTGATGATAACACAGATGTAGACATAATCTTGAGTGGCATAGCTACTTTGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806086.1
MERSAITETWLRKHRQIYQRATRHPFILSIRDGSLHLSSFKRWLGQDYVFVRAFVPFIASILLKAWKESDDNTDVDIILSGIATLNDEVSWFKREASKWGVALDTIVPQHANLAYCSFLESLMSAGVDYTQAVTAFWAIEAVYQESFAHCLEDGCNTPDELKETCQRWGNDGFGQYCRALQSIANRQLEKASDEVVAKAEALFIRVLELEDEFWNMSTCTM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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