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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004148`

染色体: Chr04 坐标: 56207188-56209220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004148`
名称	SmilChr04G004148
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 32
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56207188 - 56209220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021028`
GeneID	`131021028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021028`
原始查询	`LOC131021028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 32
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 32
Arabidopsis	`AT3G17000` (UBC32) ubiquitin-conjugating enzyme 32 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820956] identity=63.4; qcov=1.07; evalue=2.48e-134; confidence=high
Rice	`Os03g0308000` (OsUBC45) - identity=58.8; qcov=1.08; evalue=9.99e-120; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057806089.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057806089.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057806089.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806089.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806089.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56208759`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A23,B11,B23,B41,B55,B59,C11,C20,C38,C51,C69,D9
`Chr4:56208937`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B134,C85
`Chr4:56208954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C16,C55,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806089.1

293 aa

146

293

UQ_con

PF00179 UQ_con 15-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806089.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	15	126	9.1e-20	71.4	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950106.1
GAAATCCTAACACGTAAGCACATCCACGACAGATGACGTGTCGCCCGCCTCTCTCTCTCTTCATAACCTATCCATCAGAGTGGAATTGAATCAAAAGTTGAATCTTTTTTTATAAATCTGTAGAATTTCGTGTCGGCGAGGGGATTTTGCTGCCGTGAAAGTGAATCGAGGTGGGGGAAAATGGCGGAAGATAAGTACAATCGGAAGAATCCGGCGGTGAAGAGGATTCTGCAGGAGGTCAAAGAGATGCAATCCAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021028
ATGGCGGAAGATAAGTACAATCGGAAGAATCCGGCGGTGAAGAGGATTCTGCAGGAGGTCAAAGAGATGCAATCCAATCCTTCCGATGACTTTATGAGCCTGCCTCTCGAGGAGAATATATTTGAATGGCAGTTTGCGATCAGGGGTCCGAGAGATTCGGAGTTTGAGGGAGGAATATACCATGGAAGAATTCAGCTGCCGGCTGAATATCCTTTCAAGCCACCTTCATTCATGCTGCTCACGCCGAATGGTCGGTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806089.1
MAEDKYNRKNPAVKRILQEVKEMQSNPSDDFMSLPLEENIFEWQFAIRGPRDSEFEGGIYHGRIQLPAEYPFKPPSFMLLTPNGRFETQTKICLSISNHHPEHWQPSWSVRTALVAMIAFMPTSPNGALGSLDYTKEERRALAIKSRDAAPRFGSAERQKLIDEIHEYMLSKALPVPEDTVVQTGNEESAEVEQTPNQDVEAAAEAEPQAAEDDEIVEEPNRTATPPIAAEASNPVPANEQQLLQKPETRAPRQADDRLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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