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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001824`

染色体: Chr01 坐标: 33184536-33187101 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001824`
名称	SmilChr01G001824
描述	uncharacterized SmilChr01G001824
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33184536 - 33187101 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021029`
GeneID	`131021029`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021029`
原始查询	`LOC131021029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817846]; symbol=AT2G32850; hit=AT2G32850; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817846]; symbol=AT2G32850; hit=AT2G32850; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G32850` (AT2G32850) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817846] identity=43.7; qcov=0.893; evalue=8.31e-113; confidence=medium
Rice	`Os02g0591900` (OSJNBa0016G10.6-2) - identity=41.5; qcov=0.882; evalue=8.36e-96; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021029

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806093.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806093.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057806093.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057806093.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057806093.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33184719`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	126	A1,A13,A15,A24,A3,A6,A8,B1,B102,B107,B108,B110,B112,B113,B115,B120,B123,B125,B126,B128,B129,B13,B132,B134,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B22,B24,B25,B3,B31,B33,B38,B39,B41,B44,B45,B46,B49,B50,B53,B55,B56,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B81,B82,B84,B86,B87,B88,B9,B90,B94,B96,B99,C11,C13,C18,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C30,C32,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C47,C50,C52,C54,C6,C61,C63,C66,C68,C69,C7,C72,C75,C77,C78,C79,C8,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D3,D4,D8,D9
`Chr1:33184775`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:33184775`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:33184790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:33184798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr1:33184799`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	249	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B75,B76,B77,B78,B79,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr1:33184810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr1:33184820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B115,B53
`Chr1:33184831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C22,C53
`Chr1:33184833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B32,B65,B86,C75
`Chr1:33184915`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A14,A20,A21,B26,B9,B97,C22,C27,C43,C51,C68,C69,C77,D6
`Chr1:33184980`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	122	A1,A13,A15,A21,A24,A3,A6,A8,A9,B1,B102,B107,B108,B110,B111,B112,B113,B120,B123,B125,B126,B129,B13,B136,B137,B139,B14,B140,B19,B2,B21,B25,B3,B33,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B47,B50,B53,B55,B56,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B77,B79,B8,B81,B82,B84,B85,B86,B88,B9,B90,B92,B94,B96,B97,B99,C11,C13,C17,C18,C2,C20,C23,C24,C26,C27,C3,C30,C32,C38,C4,C40,C41,C43,C45,C46,C50,C54,C55,C6,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C72,C75,C76,C78,C79,C8,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D3,D4,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806093.1

587 aa

294

587

Pkinase

PF00069 Pkinase 29-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806093.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	29	130	1.6e-14	54.7	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950110.1
TGCTATAATTTTTTAATAATGATATCACCTTTCAGTCGTTAATTTTTGTAAAGAATCACAACAAGCCATGTGGAGATTCAAACCCTTCGCGCACAAAGTCGGGCTTGAAGGACGTGTTATTGACATCTGCAATTTCAAAGTTTCGGTTCACAATCTAATTGCGGAGGGTGATTTCTCCTGTGTTTATTTAGCTCGAGATGCAGTAAATGGCTTCAAGCAGTATGCATTAAAGCACATAATATGTAATGATGAAGAGTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021029
ATGTGGAGATTCAAACCCTTCGCGCACAAAGTCGGGCTTGAAGGACGTGTTATTGACATCTGCAATTTCAAAGTTTCGGTTCACAATCTAATTGCGGAGGGTGATTTCTCCTGTGTTTATTTAGCTCGAGATGCAGTAAATGGCTTCAAGCAGTATGCATTAAAGCACATAATATGTAATGATGAAGAGTCACGGGAGCTAGTGGCAGAGGAGATTTCAGTTATGAAAACAGTTACAGGCCACCCCAATGTTGTTACCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806093.1
MWRFKPFAHKEXGLEGRVIDICNFKVSVHNLIAEGDFSCVYLARDAVNGFKQYALKHIICNDEESRELVAEEISVMKTVTGHPNVVTLLAHAVFDMGRTKEAFLLMEYCEKSFEKPEEMGIEEDNIRKHTRSYCCTSLWDLFRRELINEKVDIWAVGCLLFRICYLKLAFDGESKLQILNGNYRIPXTLLTNLIRDMLQSSPDDRPDITQVWFRVNDLLPDELQKSVPDRPPEMLQQSTDAITGTPKPVNKSSPMPRRSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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