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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G004177`

染色体: Chr04 坐标: 56366051-56368961 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G004177`
名称	SmilChr04G004177
描述	uncharacterized SmilChr04G004177
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	56366051 - 56368961 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021062`
GeneID	`131021062`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021062`
原始查询	`LOC131021062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0329400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0329400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G15640` (AT5G15640) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831418] identity=50.8; qcov=0.972; evalue=2.46e-112; confidence=high
Rice	`Os01g0329400` - identity=72; qcov=0.954; evalue=9.92e-174; confidence=high
GO	GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021062

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057806123.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057806123.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057806123.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806123.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:56366946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D10
`Chr4:56367596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:56367722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806123.1

326 aa

163

326

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 33-115 aa PF00153 Mito_carr 131-218 aa PF00153 Mito_carr 238-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806123.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	33	115	9.5e-57	189.5	Mitochondrial carrier protein
`XP_057806123.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	131	218	9.5e-57	189.5	Mitochondrial carrier protein
`XP_057806123.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	238	323	9.5e-57	189.5	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100829.1
AATTGTCCTGAAAATGTGGAAGCTCCCATGTGTATGACTATGGTGCACCGTTCGAACCTTCTGCACTATTTACTTCTTTGCAAAGGAAAAAGAAAACATTTTTCATCAACTCCGACCTTCTCTCTTCACTAGACGTTCTATTCTAATCGGAGAAAGGAATGGCCCTAGAAGCCGCAGACGTTGCCACCCCTCCTCAATTGGCTCTCGCCGACACCGACGTCAACTGGGACAGGCTGGATAAGACAAGGTTTCACGTGATC...

XR_009100830.1
AATTGTCCTGAAAATGTGGAAGCTCCCATGTGTATGACTATGGTGCACCGTTCGAACCTTCTGCACTATTTACTTCTTTGCAAAGGAAAAAGAAAACATTTTTCATCAACTCCGACCTTCTCTCTTCACTAGACGTTCTATTCTAATCGGAGAAAGGAATGGCCCTAGAAGCCGCAGACGTTGCCACCCCTCCTCAATTGGCTCTCGCCGACACCGACGTCAACTGGGACAGGCTGGATAAGACAAGGTTTCACGTGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021062
ATGGCCCTAGAAGCCGCAGACGTTGCCACCCCTCCTCAATTGGCTCTCGCCGACACCGACGTCAACTGGGACAGGCTGGATAAGACAAGGTTTCACGTGATCGGGGCTATTCTATTTACAATTCAGTCAGCCTTAATACACCCTACAGCGGTTGTGAAGACAAGAATGCAAGTAGCTGGATCTGATATCTCTAAGGTGAATGGGCTATCTGTTTTCAGACACATTATCAGGAGTGATGGTATTCCTGGTATTTTCAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806123.1
MALEAADVATPPQLALADTDVNWDRLDKTRFHVIGAILFTIQSALIHPTAVVKTRMQVAGSDISKVNGLSVFRHIIRSDGIPGIFRGFGTSAIGSLPGRVLALTSLEMSKDMTLKYTKGLDMPEATRIGIANGVAGMVSNLVSCVYFVPLDVVCQRLMVQGVPGTTICNGPSDVVRKVIRAEGFRGLYRGFGLTATYQTPASALWWGSYGSAQHMIWRSLGYSDDMEKKPSHVELVTVQATAGMVAGACSSMITTPIDTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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