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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000056`

染色体: Chr04 坐标: 495208-500835 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000056`
名称	SmilChr04G000056
描述	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	495208 - 500835 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021090`
GeneID	`131021090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021090`
原始查询	`LOC131021090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 1, mitochondrial
产物	3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G60510` (AT3G60510) ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825222] identity=65.5; qcov=0.951; evalue=3.28e-178; confidence=high
Rice	`Os10g0552900` - identity=65.7; qcov=0.899; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003860 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase activity); GO:0006574 (L-valine catabolic process)
KEGG	smil00280 (Valine, leucine and isoleucine degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00640 (Propanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00378 (ECH_1); PF16113 (ECH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057806164.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057806164.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806164.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806164.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:495445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:497450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:497459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:498579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B19,C82
`Chr4:499673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B131,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806164.1

405 aa

202

405

ECH_2

ECH_1

PF16113 ECH_2 51-384 aa PF00378 ECH_1 55-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806164.1`	Pfam	`PF16113`	ECH_2	Domain	51	384	1.4e-117	393.7	Enoyl-CoA hydratase/isomerase
`XP_057806164.1`	Pfam	`PF00378`	ECH_1	Domain	55	239	4e-25	89.3	Enoyl-CoA hydratase/isomerase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950181.1
TAAAATTTATTATTTATATTAAATGTTTGTGACCCATTCATAATTATCTCTATTTTTATTTAAAACATAATCATCATTTTTTTAAAAAAAATTATTCTTTTTTATATTTTATTATAAAGTATTTATTTATTTCGAAACATTTGTAGCCTATTCAATTGGGAGAGAGTCTTTATTTAAGTGTGTTAGCAAAGGAAAGAATTCGAAATCAAAGGCTGTGAAATTCGGCGAAGTGAAGAGTGAAATTGGTCGGGAAATTATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021090
ATGCGACTCTGTAAATATGCATTGATTCGCCGGTGGATTCTTTCCGGCGAGAAGATCAGTTATGGCTCCAGACGCTTTGCCTCTCTCTCCAGCAATCCCCTCATTGATGATTCTCATAATTTAGTACTTGTTGAGGGCAAAGCAAGTTCAAGAACAGCAATTCTCAACAGACCCGCATCTCTCAATGCTCTGAACACCTCTATGGTTGCCAGGCTTCAGGAGTTGTATAAAAATTGGGAAGAAGACCCTGGTGTGGGTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806164.1
MRLCKYALIRRWILSGEKISYGSRRFASLSSNPLIDDSHNLVLVEGKASSRTAILNRPASLNALNTSMVARLQELYKNWEEDPGVGFVAVKGGGRAFSAGGDIVALYNLMKEGNLEECKQFFWTIYSFIYFLGTYMKPHVALLNGITMGGGAGVSIPGTFRLATDKTIFATPETLIGFHPDAGASFYLSHLPGYMGEYLALTGEKLNGAEMLSCGLATHFSPIAKLHLVEKQLGKLATDDPSVIESSLGNQGDTVHPDQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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