当前解析结果
SmilChr04G000114| 统一新 Gene ID | SmilChr04G000114 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G000114 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G000114 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 986336 - 987355 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021101 |
|---|---|
| GeneID | 131021101 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021101 |
| 原始查询 | LOC131021101 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0587600- identity=46.8; qcov=0.139; evalue=3.15e-06; confidence=weak |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021101 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057806173.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057806173.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806173.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806173.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806173.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:986344 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr4:986400 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B60 |
Chr4:986400 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr4:986726 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,B78,C42 |
Chr4:986881 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,B44 |
Chr4:986970 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr4:987018 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B105,B88,B9 |
Chr4:987079 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr4:987107 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B43,C82 |
Chr4:987117 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B120 |
Chr4:987118 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,B112,B24,B79,C15 |
Chr4:987132 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,B92 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。