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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000224`

染色体: Chr04 坐标: 1999515-1999907 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000224`
名称	SmilChr04G000224
描述	uncharacterized SmilChr04G000224
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	1999515 - 1999907 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021117`
GeneID	`131021117`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021117`
原始查询	`LOC131021117`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=35.3; qcov=0.523; evalue=2.81e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=29.5; qcov=0.808; evalue=1.69e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021117

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806190.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806190.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806190.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806190.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806190.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:1999516`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A11,A22,A7,B17,B23,B42,B43,B50,B52,B58,B62,B9,B94,C1,C16,C18,C19,C26,C41,C47,C62,D3
`Chr4:1999539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:1999552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,D11,D7
`Chr4:1999563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B65
`Chr4:1999565`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr4:1999565`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B59
`Chr4:1999587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B59
`Chr4:1999587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:1999600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B108,B122,B24
`Chr4:1999632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:1999638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C52
`Chr4:1999655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806190.1

130 aa

130

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 9-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806190.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	9	101	1.4e-17	64.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950207.1
ATGGCAGACAGGAACGGAGCTCACTCGGTCAAATCGGCATATAAAGTGTTAAGTGCAGCAGCAACTACCTCCTCCCAGCGTGAGGTCTGCCTTGAGCTCCCACCAATCTGGAAAGCTCGAGTGTCGTTCAAAGCAAAAACTGTGACGTGGAGAATATTTAAAGGAAGGCTTCCAACCTGCGACAACCTTCTTAGAAGACAGGTACCTCTTTCGGCTTCGGATGTCCTGTGCACGGCGTGTGAAGAGGAAAATGAATCGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021117
ATGGCAGACAGGAACGGAGCTCACTCGGTCAAATCGGCATATAAAGTGTTAAGTGCAGCAGCAACTACCTCCTCCCAGCGTGAGGTCTGCCTTGAGCTCCCACCAATCTGGAAAGCTCGAGTGTCGTTCAAAGCAAAAACTGTGACGTGGAGAATATTTAAAGGAAGGCTTCCAACCTGCGACAACCTTCTTAGAAGACAGGTACCTCTTTCGGCTTCGGATGTCCTGTGCACGGCGTGTGAAGAGGAAAATGAATCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806190.1
MADRNGAHSVKSAYKVLSAAATTSSQREVCLELPPIWKARVSFKAKTVTWRIFKGRLPTCDNLLRRQVPLSASDVLCTACEEENESVEHFFFVCKRSCELWDAILLWIGKYTALHHKASEHFATFSNIGD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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