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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000300`

染色体: Chr04 坐标: 2780105-2781652 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000300`
名称	SmilChr04G000300
描述	uncharacterized SmilChr04G000300
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2780105 - 2781652 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021137`
GeneID	`131021137`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021137`
原始查询	`LOC131021137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0590366; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=28.1; qcov=0.469; evalue=2.19e-07; confidence=low
Rice	`Os04g0590366` - identity=25.5; qcov=1.09; evalue=5.86e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021137

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806209.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806209.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806209.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806209.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806209.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2780639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:2780648`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A14,B133,B3,B49,B78
`Chr4:2780648`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A14,B133,B3,B49,B78
`Chr4:2780650`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A14,B133,B3,B49,B78
`Chr4:2780650`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A14,B133,B3,B49,B78
`Chr4:2780687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr4:2780769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C2
`Chr4:2780780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:2780867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:2780875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	63	A1,A11,A18,A22,A3,A5,A7,B101,B108,B110,B118,B124,B129,B130,B136,B140,B15,B26,B29,B34,B40,B5,B64,B68,B71,B74,B75,B78,B8,B82,B87,B88,B93,B94,B99,C10,C16,C28,C32,C33,C35,C36,C37,C46,C48,C51,C55,C56,C57,C58,C61,C62,C68,C74,C77,C78,C80,C83,C84,D3,D5,D6,D9
`Chr4:2780945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B34,B8,C64,C66
`Chr4:2780955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806209.1

288 aa

144

288

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 26-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806209.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	26	123	9.9e-09	36.8	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950226.1
ATGAGCCAAGCAACTCAAGGTAGCACAGGAACTACATGTTCTGGCCGTGTCAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGCAGTTGGTCCGTTAGGGAAGAAGAAGTTCTAATCGTTGCATTGAAAGAGCTCATTGCACTTGGATGGAAATCTGACAACGGGTTCCGAGCCGGCTATTTGAGTAAGTTAGAGGAGGCTATGAAGAAGGAATTTCCGACCACCGACTTGAAGGGAATGCCTCATATAAACTCGAAGATGACAACGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021137
ATGAGCCAAGCAACTCAAGGTAGCACAGGAACTACATGTTCTGGCCGTGTCAACAAGACGGACCAAAAGCGCCGCAGTTGGTCCGTTAGGGAAGAAGAAGTTCTAATCGTTGCATTGAAAGAGCTCATTGCACTTGGATGGAAATCTGACAACGGGTTCCGAGCCGGCTATTTGAGTAAGTTAGAGGAGGCTATGAAGAAGGAATTTCCGACCACCGACTTGAAGGGAATGCCTCATATAAACTCGAAGATGACAACGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806209.1
MSQATQGSTGTTCSGRVNKTDQKRRSWSVREEEVLIVALKELIALGWKSDNGFRAGYLSKLEEAMKKEFPTTDLKGMPHINSKMTTWKKTYSSLWNILKTSGVGFNVNGKHMIDCDDEQWENFVRVDDNVRNFRYKSWPYVEDWKLIFGNDRATGDEAEDVMEAAFTMYRKLDINQPLDDGEYHVSLEDILENGETGDNVSQTQPREETVTAEKEAPTSSKKRRRSVSFDDRNEVFAQLSGIPGLSKTEKFDICNMLAKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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